如何准备＊.coskf文件、生成表面电荷分布图

＊.coskf文件是进行COSMO－RS模拟所需要的（溶质分子、溶剂分子）文件，例如NaCl水溶液，就分别需要Na⁺、Cl^-、H₂O的＊.coskf文件。对于离子液体，就分别计算阳离子、阴离子，得到各自的*.coskf文件。

SCM LOGO > COSMO-RS进入流体热力学模块，默认情况下，会提示到官网下载分子库文件。该分子库包含1872种分子的＊.coskf文件。如果我们要计算的（溶质、溶剂）分子，这个库里面没有，那么就需要我们自己通过ADF模块准备。过程非常简单：

建模的操作，参考：AMS软件建模教程

点击窗口底部 ⚙ 按钮，分子将被使用UFF力场快速地优化得到较为合理的结构，一般较小的分子几秒钟就优化完了，大分子则慢一些。然后用Mopac方法，进一步精确优化：右键点击 ⚙ 按钮，选择Mopac，然后就会继续优化，一般小分子一分钟以内就优化好了，大一些的会慢一些，建议多优化几次。

这种情况不能用UFF力场优化，所以直接右键点击 ⚙ → Mopac优化即可。原子数比较多的话，建议多优化几次。

这个过程实际上包含了2个步骤，软件自动连续完成了：

1. 精确地采用DFT优化（所以前面用UFF、Mopac优化得到很好的结构，能够大大减小这一步的时间）
2. 使用DFT生成*.coskf

AMSinput > Main > Task > COSMO-RS Compound，则所有相关的参数都自动选好了。唯独需要调整的是：

• Total Charge：分子是否带电。例如H3O⁺带电为1、OH^-带电为-1
• Spin Polarizaition：自旋极化。也就是有多少个电子没有配对，N重态的自旋极化值＝N-1。如果需要设置该项，需要勾选Unrestricted。

例如，H3O⁺的分子的参数：

注意其他参数不允许修改！这些参数与COSMO-RS模块中的参数是对应的，修改这些参数将导致与COSMO-RS、COSMO-SAC的参数匹配度降低，从而结果质量下降！

File > Save as保存任务，之后提交任务。软件的并行计算，参考Linux、Windows桌面系统：使用图形界面提交任务、指定任务核数

计算完毕之后，任务所在文件夹里面，就有了*.coskf文件供COSMO-RS模块使用。

查看σ-Profile对应的表面电荷三维空间分布：SCM → View → Add → COSMO:Surface Charge Density → On COSMO surface points/on COSMO surface (reconstructed)两个选项，前者是点分布：

第二个选项是面分布（点击底部COSMO surface → Show details → 修改透明度Opacity）：

SCM LOGO > COSMO-RS打开COSMO-RS模块。在COSMO-RS窗口点击Compounds > Add Compound(s) 添加前面生成的*.coskf文件(注意更改“文件选择窗口”右下角，文件类型为coskf，不然可能找不到。

添加完毕之后，窗口会列出所有导入的分子，对某些性质计算（具体可以参考相应的教程），用户需要在下方Input Data中，为这些分子添加更精细的实验参数：

1. 对固体的溶解度来说，熔点、熔化焓（Melting point，Δ_fusion H）的数值非常重要，注意，没有实验数据的情况下，点击Estimate按钮可以估算一个数值，如果不估算也不输入，则该值将使用0值，精度将大大下降；
2. 计算蒸汽压、气液相平衡、共沸等性质时，蒸汽压方程数据非常重要，注意，Antoine系数最好有实验数据，没有实验数据的情况下，点击Estimate按钮可以估算一个数值，如果不估算也不输入，则该值将使用0值，精度将大大下降；