UFFTYPER: Warning: hybridization set to SP3 for atom...

AMS的conformer调用了RDKit算法，这个报错是RDKit内部的报错，实际上和AMS没有直接关系。RDKit在猜测新的构象时，使用UFF原子类型来确定合理的键距离，因此，警告实际上不是问题，一般可以忽略。

另外，当得到的异构体数目为0时，如果结构本身确实没有异构体，这种情况是人工可以很简单判断出来的）。如果人工无法判断，用户可以检查RDKit猜测出的结构和优化结构是不是一直的（是不是一个势阱里面的）。在*.run 文件中，修改如下：

GeometryOptimization
WriteGeometries
Enabled Yes
End
End
Output
KeepWorkDir Yes
End

conformers.results/conf_tmpdir文件夹中，将得到一个DCD格式的movie文件。使用Python脚本，可以将其转化为AMSMovie可以读取的文件。命令格式：

amspython convert.py path/to/moleculefile path/to/dcdfile.dcd

moleculefile可以是*.XYZ文件，也可以是AMS的*.in文件。这样的文件是必要的，因为DCD文件重量很轻，不包含元素信息。