建模

分子与周期性体系建模：

• 分子建模（视频）
• 建模：创建球形团簇
• 取代基效应研究（批量建模）
• 利用点群创建高对称分子
• 晶体建模
• 分子晶体中，分子间电荷转移计算的建模
• 从分子晶体中提取分子结构进行DFT计算
• 从三维晶体切割出二维表面
• 创建孔洞结构
• 聚合物建模
• 从已知单体平面结构，创建二维周期性结构
• 结构整体平移，形成错位双层结构
• 二维双层周期结构，翻转其中一层
• 如何创建分区

反应分子动力学体系建模（图形化操作界面集成Packmol程序，自动生成随机结构）：

• 【入门基础教程】创建固体表面，并均匀加入其它气体、液体分子
• 【入门基础教程】创建均匀混合物
• 创建液体-真空二元体系
• 【入门基础教程】创建高密度大分子固体、分子动力学压缩与拉伸
• 删除当前结构模型中特定的分子

精细操控位置

• 如何精确转动分子
• 表面吸附分子到顶位、桥位、孔位的精确调控(参考链接全文中的第二大节8.2小节)