在ReaxFF模块生成的*.run文件中,有control字段,从
cat > control <<eor
开始,到往下第一个
eor
的位置结束。 这个字段是关于MD的控制参数设置,也就是图形界面中的各种模拟参数设置。默认情况下,没有键级的cut off设置,但用户可以自己添加进去。每个关键字占一行。对其方式,可以参考该字段其他参数行。位置可以该字段内任意行均可。
如下:
cat > control <<eor ...省略 ...省略 ...省略 90.000 angle1 cell angles 90.000 angle2 cell angles 90.000 angle3 cell angles 25 irecon Frequency of reading control-file 5 ixmolo xmolout 0: xyz only, 1: xyz + vels + molnr, 2: xyz + mol.nr, 5: xyz + bonds 0.0010 cutof2 BO-cutoff for valency angles and torsion angles 0.300 cutof3 BO-cutoff for bond order for graphs ...省略 ...省略 eor
表示在MD计算过程中键角的截断值为0.001(默认值也是这个值),0.3是图形显示的截断(默认)值,也就是键级低于0.3,图形界面里面就不显示键级了。