1,在AMSinput中File-import Coordinates,导入Au晶体结构的*.cif文件,然后创建超胞。或者在AMS自带晶体数据里面导入:
Edit - Crystal - Genrate Super Cell设置超胞为9*9*9,这样尺寸就很大,从这样的方形盒子切出一个1000原子左右的球,应该是足够了,如果尺寸不够大,则需要进一步调整超胞的尺寸。
2,划定球区域:
超胞创建好之后,选中中心附近某个原子:
Select - Select within radius - 输入球的半径,例如6埃,然后Select - Invert Selection,然后按删除键,模型就创建好了。ctrl a显示有55个原子:
周期性修改为None。File - Export Coordinates,即可导出xyz文件。