以下以聚乙烯为例说明,使用AMS2019.301完成。
第一步:先创建两个单体,并使用MOPAC简单优化:
第二步:选中两个单体中的等价原子,从而测量聚合物重复单元的长度,例如本例,长度为252.3pm=2.523埃:
并将该方向设置为x轴:Edit - Align - With X-Axes,View - Axes可以查看坐标轴
第三步:删掉其他原子,只保留一个重复单元,并切换到DFTB、MOPAC,需要设置Main - Periodicity:Chain
第四步:修改晶格常数为2.523,菜单栏Bonds - Guess Bonds:
初步模型就创建好了。