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atk:分子器件模拟

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atk:分子器件模拟 [2017/03/05 18:51] – [分子器件模拟] dong.dongatk:分子器件模拟 [2021/12/16 11:23] (当前版本) – ↷ 链接因页面移动而自动修正 59.51.24.40
行 3: 行 3:
 本教程专门介绍分子器件的计算和分析，研究的经典器件由一个对苯二硫酚（DTB）与两个金电极表面构成，这个结构在很多文献里都有报道。 本教程专门介绍分子器件的计算和分析，研究的经典器件由一个对苯二硫酚（DTB）与两个金电极表面构成，这个结构在很多文献里都有报道。
  
-本教程中的计算时间很长，作为入门的ATK量子输运计算教程，请参考：+本教程中的计算时间很长，作为入门的QuantumATK量子输运计算教程，请参考：
   * [[atk:使用atk研究电子输运|]]   * [[atk:使用atk研究电子输运|]]
  
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   * [[atk:构建金-dtb-金分子结|]]   * [[atk:构建金-dtb-金分子结|]]
  
-本教程中使用的ATK-DFT方法参见ATK的使用手册。+本教程中使用的ATK-DFT方法参见QuantumATK的使用手册。
  
  
行 19: 行 19:
 <WRAP center important 100%> <WRAP center important 100%>
 === 注意 === === 注意 ===
-这个几何结构未经优化。这对本教程中要讨论的概念没有影响，但对于实际研究中的计算，结构优化至关重要。要了解如何弛豫器件几何结构，请参见：+这个几何结构未经优化。这对本教程中要讨论的概念没有影响，但对于实际研究中的计算，结构优化至关重要。要了解如何弛豫器件几何结构，请参见：[[atk:如何弛豫器件体系的几何结构|]]。
  
 </WRAP> </WRAP>
行 51: 行 51:
  
 <WRAP center info 100%> <WRAP center info 100%>
-并行计算可以大幅度提升计算速度，要了解如何并行计算，请参考：[[atk:atk并行计算|]]。+并行计算可以大幅度提升计算速度，要了解如何并行计算，请参考：[[atk:quantumatk并行计算]]。
 </WRAP> </WRAP>
  
行 136: 行 136:
 要同时将结构显示在图上，只需要将 DeviceConfiguration 数据对象拖动到上面已经显示了本征态的Viewer窗口里。 要同时将结构显示在图上，只需要将 DeviceConfiguration 数据对象拖动到上面已经显示了本征态的Viewer窗口里。
  
-{{:atk:eigen13.png?200 |}}{{:atk:eigen14.png?200 |}} +<WRAP center box 100%> 
-{{:atk:eigen15.png?200 |}}{{:atk:eigen16.png?200 |}}+{{:atk:eigen13.png?400 |}}{{:atk:eigen14.png?400 |}} 
 +{{:atk:eigen15.png?400 |}}{{:atk:eigen16.png?400 |}} 
 +</WRAP> 
  
 注意到，所有的态都是关于苯分子平面反对称的，这说明这几个态都是苯分子的 $\pi$-轨道，由与平面垂直的碳原子 6 个 pz 轨道线性组合而成的，因此这样的 $\pi$-轨道共有 6 个。 注意到，所有的态都是关于苯分子平面反对称的，这说明这几个态都是苯分子的 $\pi$-轨道，由与平面垂直的碳原子 6 个 pz 轨道线性组合而成的，因此这样的 $\pi$-轨道共有 6 个。
行 166: 行 169:
  
 <WRAP center info 100%> <WRAP center info 100%>
-前面两个能量处只有一个透射本征态主导，最后一个能量处则有两个主导的透射本征值。后面会讨论为什么他们没有加在一起给出总的透射谱 T(E)。+前面两个能量处只有一个透射本征态主导，最后一个能量处则有两个主导的透射本征值。后面会讨论为什么他们加在一起没有得到总的透射谱 T(E)。
 </WRAP> </WRAP>
  
行 214: 行 217:
 {{ :atk:eigenvalues1.png?600 |}} {{ :atk:eigenvalues1.png?600 |}}
  
-  * 选中第一个本征值，点击 Eigenstates 按钮。稍等片刻，第一个本征值对应的本征态就计算好了，Viewer 窗口自动弹出。适当调整 isovalue 数值，得到漂亮的图。+  * 选中第一个本征值，点击 Eigenstates 按钮。稍等片刻，对应的本征态就计算好了，Viewer 窗口自动弹出。适当调整 isovalue 数值，得到漂亮的图。
  
 {{ :atk:eigenstates.png?400 |}} {{ :atk:eigenstates.png?400 |}}
行 331: 行 334:
 为使用 1.6V 和 0V 的 ElectrostaticDifferencePotential 和 ElectronDifferenceDensity 结果计算电压降，我们使用右侧的GridOperations工具。 为使用 1.6V 和 0V 的 ElectrostaticDifferencePotential 和 ElectronDifferenceDensity 结果计算电压降，我们使用右侧的GridOperations工具。
  
-  * 按住 ''ctrl'' 键同时选中 ''voltage_drop_16V'' 和 ''voltage_drop_0V'' 中的 $\detal V_E(\vec(r))$ 图标。+  * 按住 ''ctrl'' 键同时选中 ''voltage_drop_16V'' 和 ''voltage_drop_0V'' 中的 $\delta V_E(\vec(r))$ 图标。
   * 点击打开 **GridOperations** 工具；   * 点击打开 **GridOperations** 工具；
   * 设置函数为 A1 - B1；   * 设置函数为 A1 - B1；
行 340: 行 343:
 重复上述步骤，计算电压诱导的电荷密度。 重复上述步骤，计算电压诱导的电荷密度。
  
-{{:atk:edd.png?600 |}}+{{ :atk:edd.png?600 |}}
  
 现在计算结果分别保存于 ''EDP.nc'' 和 ''EDD.nc''。要图示这两个结果： 现在计算结果分别保存于 ''EDP.nc'' 和 ''EDD.nc''。要图示这两个结果：
行 351: 行 354:
 在 Property 里详细调节图示的细节。 在 Property 里详细调节图示的细节。
  
-{{:atk:edp1.png?600 |}} +{{ :atk:edp1.png?600 |}} 
-{{:atk:edd1.png?600 |}}+{{ :atk:edd1.png?600 |}}
  
 如果设置如上图，则得到下面的图： 如果设置如上图，则得到下面的图：
  
-{{:atk:voltage_drop.png?600 |}}+{{ :atk:voltage_drop.png?600 |}}
  
 将电压降进行一维作图通常比较有用：选中 EDP 中的 $f(x)$ 图标，点击右侧的 **1D Projector** 工具。投影方法改为 //Average//，点击 //Add Line//。 将电压降进行一维作图通常比较有用：选中 EDP 中的 $f(x)$ 图标，点击右侧的 **1D Projector** 工具。投影方法改为 //Average//，点击 //Add Line//。
  
-{{:atk:voltage_drop_1d.png?600 |}}+{{ :atk:voltage_drop_1d.png?600 |}}
  
 此处的一维投影作图，C轴取值范围为 0 ~ 1，对应了真实的 z 方向长度。 此处的一维投影作图，C轴取值范围为 0 ~ 1，对应了真实的 z 方向长度。
atk/分子器件模拟.1488711116.txt.gz · 最后更改: 2017/03/05 18:51 由 dong.dong

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