adf:restrictopt2020

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--- adf:restrictopt2020 [2020/11/12 21:50] – 创建 liu.jun
+++ adf:restrictopt2020 [2020/11/16 20:37] (当前版本) – liu.jun
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-======如何进行限制性结构优化======
+======限制性结构优化======
+本文使用AMS2020.101完成。
 目的：在结构优化的时候，固定某些键长、键角、二面角。
-操作：基本设置与[[adf:geoopt2020|普通的结构优化]]相同。另外需要增加的设置如下：
+操作：基本设置与[[adf:geoopt2020|普通的结构优化]]相同。点击窗口底部的★符号，程序计算的时候，才能自动识别点群，优化过程将保持该点群。
-  - 进入Model - Geometry constraints and LT；
+{{ :adf:2020geoconstaints03.png?650 }}
-  - 依次选中原子。所谓依次：
-    - 如果需要固定两个原子之间的距离（键长），则选中两个原子即可，顺序无所谓；
-    - 如果需要固定键角，则需要将键角顶点原子第二个被选中，例如如果我们希望固定水分子中H-O-H键角，则首先选中H，然后选中O，然后选中H；
-    - 二面角与此类似，二面角转动轴上的两个原子在中间，4个原子按顺序选中。
-例如下图中，选中两个C原子，右侧出现C(20)C(5)(distance)，表示$C_{20}C_5$之间的距离，点击前面的＋，即可实现固定该键长。
+另外需要增加的设置如下：
-{{ :adf:geoconstaints.png?650 }}
+  - 进入Model - Geometry Constraints and PES Scan；
+  - 设置固定条件：
+    - 如果需要固定两个原子之间的距离（键长），则选中两个原子即可，顺序无所谓，之后点击右侧出现的“......(distance)”选项前的＋，则可以固定该键长
+    - 如果需要固定键角，则需要将键角顶点原子第二个被选中，例如如果我们希望固定水分子中H-O-H键角，则首先选中H，然后选中O，然后选中H；之后点击右侧出现的“......(distance)”选项前的＋，即可固定该键角
+    - 二面角与此类似，二面角转动轴上的两个原子在中间，4个原子按顺序选中，之后点击右侧出现的“......(dihedral)”选项前的＋，即可固定该二面角。
+    - “......(fix position)”选项前的＋，可以固定选中的原子的坐标。例如：
+{{ :adf:2020geoconstaints02.png?650 }}
-另外，需要修改坐标系为笛卡尔坐标：Details > Geometry Convergence > Coodinates used for optimization: Catesian
+保存任务后运行。
+=====结果查看=====
+SCM - Movie:
+{{ :adf:2020geoconstaints01.png?650 }}
+可以看到固定位置的原子在优化过程中，没有发生移动。

adf/restrictopt2020.1605189048.txt.gz · 最后更改: 2020/11/12 21:50 由 liu.jun

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