adf:ir2020

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--- adf:ir2020 [2020/11/23 19:06] – [分子的频率、红外、零点能、转动能量、转动惯量、熵、焓、热熔与Gibbs自由能] liu.jun
+++ adf:ir2020 [2024/05/29 17:03] (当前版本) – [气相分子的频率、红外IR、零点能、转动能量、转动惯量、熵、焓、热容与Gibbs自由能、液相自由能与焓的计算] liu.jun
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-====== 分子的频率、红外、零点能、转动能量、转动惯量、熵、焓、热熔与Gibbs自由能的计算======
+====== 气相分子的频率、红外IR、零点能、转动能量、转动惯量、熵、焓、热容与Gibbs自由能，液相自由能与焓的计算======
 =====第一步，优化分子结构=====
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 {{ :adf:2020frequencies03.png?650 }}
-如果有虚频，则虚频的峰为负数，此例中没有虚频。点击峰的位置，或者下方列表中计算得到的某一行（每一行对应一个峰、一个模式），则显示该峰对应的振动模式的振动动画。
+如果有虚频，则虚频的峰为负数，此例中没有虚频。
+<color green>点击峰的位置，或者下方列表中计算得到的某一行（每一行对应一个峰、一个模式），则显示该峰对应的振动模式的振动动画。</color>
 ====零点能====
 点击SCM > Output > 窗口底部搜索“Zero-point energy”可以看到零点能：
@@ 行 30: / 行 32: @@
  Zero-point energy (Hartree):     0.0771
 </code>
+Bonding Energy加上零点能即考虑了零点能矫正。
 ====转动惯量====
 Output窗口底部搜索“Moments of Inertia”，显示转动惯量的数值，及其主轴：
@@ 行 74: / 行 76: @@
   * 转动能级的计算：Moments of Inertia，转动惯量I，在前面有列出。转动能级E<sub>rotate</sub>=h<sup>2</sup>*J(J+1)/8π<sup>2</sup>I，其中J为转动量子数也就是能级序号，I为转动惯量（非负整数），h为普朗克常数（h=6.62606896×10<sup>-34</sup>J·s），π＝3.141593。转动能级本身通过玻尔兹曼分布进行平均，得到该温度下的转动能量。
   * Summary of energy terms，列出了电子内能（即Energy from Engine）、焓、Gibbs自由能等信息。
+  * （c）是进行了低频热力学修正之后的值，参考：https://www.scm.com/doc/AMS/Vibrational_Spectroscopy.html#thermodynamics
+  * 这里的自由能是气相的自由能，**液体自由能的计算**，参考：[[adf:calcualteliquidfreeenergy]]
+=====补充：只计算部分原子相关的振动、Gibbs自由能等，如何设置？=====
+====设置====
+其他设置如上文所示，增加设置如下：
+  * 将需要计算振动的这部分原子设置为一个Region（设置方法参考：[[adf:creatregion]]）
+  * Properties → IR(Frequency),VCD → Hessian only for选择该Region
+====结果====
+  * 平动、转动相关的能量，全部原子考虑在内
+  * 振动相关能量，仅仅考虑了指定这部分原子振动引起的

adf/ir2020.1606129575.txt.gz · 最后更改: 2020/11/23 19:06 由 liu.jun

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