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adf:ir2020 [2020/11/16 20:53] – [红外谱] liu.jun | adf:ir2020 [2024/05/29 17:03] (当前版本) – [气相分子的频率、红外IR、零点能、转动能量、转动惯量、熵、焓、热容与Gibbs自由能、液相自由能与焓的计算] liu.jun | ||
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行 1: | 行 1: | ||
- | ====== 分子的频率、红外、零点能、转动能量、转动惯量、熵、焓、热熔与Gibbs自由能====== | + | ====== |
=====第一步,优化分子结构===== | =====第一步,优化分子结构===== | ||
行 24: | 行 24: | ||
{{ : | {{ : | ||
- | 如果有虚频,则虚频的峰为负数,此例中没有虚频。点击峰的位置,或者下方列表中计算得到的某一行(每一行对应一个峰、一个模式),则显示该峰对应的振动模式的振动动画。 | + | 如果有虚频,则虚频的峰为负数,此例中没有虚频。 |
+ | |||
+ | <color green>点击峰的位置,或者下方列表中计算得到的某一行(每一行对应一个峰、一个模式),则显示该峰对应的振动模式的振动动画。</ | ||
====零点能==== | ====零点能==== | ||
点击SCM > Output > 窗口底部搜索“Zero-point energy”可以看到零点能: | 点击SCM > Output > 窗口底部搜索“Zero-point energy”可以看到零点能: | ||
行 30: | 行 32: | ||
| | ||
</ | </ | ||
+ | Bonding Energy加上零点能即考虑了零点能矫正。 | ||
====转动惯量==== | ====转动惯量==== | ||
Output窗口底部搜索“Moments of Inertia”,显示转动惯量的数值,及其主轴: | Output窗口底部搜索“Moments of Inertia”,显示转动惯量的数值,及其主轴: | ||
行 72: | 行 74: | ||
* 如同输出文件内容所说,这种计算Gibbs自由能的方式,引入了理想气体近似, | * 如同输出文件内容所说,这种计算Gibbs自由能的方式,引入了理想气体近似, | ||
* Transl,Rotat,Vibrat,Total三项列出了各个温度时,熵、核内能、热容的平移、转动、振动分量与总和。 | * Transl,Rotat,Vibrat,Total三项列出了各个温度时,熵、核内能、热容的平移、转动、振动分量与总和。 | ||
- | * Summary of energy terms,列出了电子内能(Energy from Engine)、焓、Gibbs自由能等信息。 | + | |
+ | | ||
+ | * (c)是进行了低频热力学修正之后的值,参考:https:// | ||
+ | * 这里的自由能是气相的自由能,**液体自由能的计算**,参考:[[adf: | ||
+ | |||
+ | =====补充:只计算部分原子相关的振动、Gibbs自由能等,如何设置?===== | ||
+ | ====设置==== | ||
+ | 其他设置如上文所示,增加设置如下: | ||
+ | * 将需要计算振动的这部分原子设置为一个Region(设置方法参考:[[adf: | ||
+ | * Properties → IR(Frequency), | ||
+ | |||
+ | ====结果==== | ||
+ | * 平动、转动相关的能量,全部原子考虑在内 | ||
+ | * 振动相关能量,仅仅考虑了指定这部分原子振动引起的 |