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adf:cddofgs [2019/12/05 15:28] – liu.jun | adf:cddofgs [2020/11/17 20:29] (当前版本) – 移除 liu.jun | ||
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行 1: | 行 1: | ||
- | ====== 如何计算片段差分密度(即:分子与片段的电子密度之差、碎片形成整体导致的电荷转移方向) ====== | ||
- | **本例以BH< | ||
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- | 第一步,[[adf: | ||
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- | 第二步,导入优化好的分子结构,划分片段,进行计算,如下图所示: | ||
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- | 按住Shift键,鼠标画框,选中NH< | ||
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- | {{ : | ||
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- | 则成功将NH< | ||
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- | {{ : | ||
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- | 启动片段功能: | ||
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- | 主面板参数设置如下图所示(基组、泛函选择参考[[adf: | ||
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- | {{ : | ||
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- | 保存任务,并运行。 | ||
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- | 第三步,结果查看: | ||
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- | 在ADFinput窗口点击SCM LOGO > View,弹出View窗口。点击Field > Calculated,窗口底部Select Field区域,分别如下图所示,选择Density - Density SCF(当前二聚体电子密度),以及Density - Density Sum Frag(孤立碎片电子密度简单叠加) | ||
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- | {{ : | ||
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- | 此时注意,Density SCF - Density Sum Frag这个函数的名称为C-1(窗口左下角)。因此我们把C-1这个函数显示出来:Add - Isosurface: | ||
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- | {{ : | ||
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- | 为了更方便观察电子密度与原子核的位置,我们把C-1函数用半透明的方式显示:点击窗口底部的Isosurface: | ||
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- | {{ : | ||
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- | <color blue> | ||
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- | AMS软件提供**免费试用**(一般为一个月),试用申请方式参见:[[adf: |