这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
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adf:bsseofband [2019/12/09 20:53] – liu.jun | adf:bsseofband [2020/11/30 16:55] (当前版本) – liu.jun | ||
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====== Ghost原子的设置与使用(用于周期性体系的BSSE修正)====== | ====== Ghost原子的设置与使用(用于周期性体系的BSSE修正)====== | ||
- | =====图形化操作方式===== | + | =====第一种方式:图形化操作===== |
- | 周期性体系的BSSE修正,原理、图形界面操作与ADF模块一致,参考[[adf: | + | 周期性体系的BSSE修正,原理、图形界面操作与ADF模块一致,参考[[adf: |
- | =====手动修改脚本的方式===== | + | =====第二种方式:手动修改脚本===== |
- | ====BAND模块的*.run文件坐标格式 ==== | + | 只需要将坐标改为: |
- | 默认生成的*.run文件,坐标格式是类似这样的: | + | |
- | <code bash> | + | |
- | ATOMS H | + | |
- | 0.04893625887 0.1606329772 -0.4241884865 | + | |
- | 0.6266772729 -0.1917748773 -0.7235612053 | + | |
- | END | + | |
- | + | ||
- | ATOMS O | + | |
- | 2.639585644 0.7559731921 1.28755038 | + | |
- | 2.199232799 0.1119645919 0.01812440903 | + | |
- | END | + | |
- | </ | + | |
- | 也就是将某一种元素列出来,然后列出该元素原子的坐标,例如上例中是2个O原子和2个H原子。 | + | |
- | + | ||
- | 要设置Ghost原子,需要手动整理一下坐标格式,修改成如下的格式: | + | |
- | <code bash> | + | |
- | ATOMS | + | |
- | H 0.04893625887 0.1606329772 -0.4241884865 | + | |
- | H 0.6266772729 -0.1917748773 -0.7235612053 | + | |
- | O 2.639585644 0.7559731921 1.28755038 | + | |
- | O 2.199232799 0.1119645919 0.01812440903 | + | |
- | END | + | |
- | </ | + | |
- | + | ||
- | 简单的说,就是在ATOMS字段内,把所有原子都列出来,第一列标记元素符号。 | + | |
- | + | ||
- | ====Ghost原子的设置==== | + | |
- | 例如上例中,我们希望将第二、三个原子设置为Ghost,那么只需要将上述坐标改为: | + | |
<code bash> | <code bash> |