adf:bsseofband
差别
这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:bsseofband [2016/09/24 00:59] – liu.jun | adf:bsseofband [2020/11/30 16:55] (当前版本) – liu.jun | ||
|---|---|---|---|
| 行 1: | 行 1: | ||
| - | ====== Ghost原子的设置与使用（待续）====== | + | ====== Ghost原子的设置与使用（用于周期性体系的BSSE修正）====== |
| + | =====第一种方式：图形化操作===== | ||
| + | 周期性体系的BSSE修正，原理、图形界面操作与ADF模块一致，参考[[adf: | ||
| - | =====BAND模块的*.run文件坐标格式 ===== | + | =====第二种方式：手动修改脚本===== |
| - | 默认生成的*.run文件，坐标格式是类似这样的： | + | 只需要将坐标改为： |
| - | <code bash> | + | |
| - | ATOMS H | + | |
| - | 0.04893625887 0.1606329772 -0.4241884865 | + | |
| - | 0.6266772729 -0.1917748773 -0.7235612053 | + | |
| - | END | + | |
| - | + | ||
| - | ATOMS O | + | |
| - | 2.639585644 0.7559731921 1.28755038 | + | |
| - | 2.199232799 0.1119645919 0.01812440903 | + | |
| - | END | + | |
| - | </ | + | |
| - | 也就是将某一种元素列出来，然后列出该元素原子的坐标，例如上例中是2个O原子和2个H原子。 | + | |
| - | + | ||
| - | 要设置Ghost原子，需要手动整理一下坐标格式，修改成如下的格式： | + | |
| - | <code bash> | + | |
| - | ATOMS | + | |
| - | H 0.04893625887 0.1606329772 -0.4241884865 | + | |
| - | H 0.6266772729 -0.1917748773 -0.7235612053 | + | |
| - | O 2.639585644 0.7559731921 1.28755038 | + | |
| - | O 2.199232799 0.1119645919 0.01812440903 | + | |
| - | END | + | |
| - | </ | + | |
| - | + | ||
| - | 简单的说，就是在ATOMS字段内，把所有原子都列出来，第一列标记元素符号。 | + | |
| - | + | ||
| - | =====Ghost原子的设置===== | + | |
| - | 例如上例中，我妈希望将第二、三个原子设置为Ghost，那么只需要将上述坐标改为： | + | |
| <code bash> | <code bash> | ||
adf/bsseofband.1474649972.txt.gz · 最后更改: 2016/09/24 00:59 由 liu.jun