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adf:bsse2020

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adf:bsse2020 [2020/11/23 19:08] – [消除BSSE] liu.junadf:bsse2020 [2022/05/12 14:41] (当前版本) – [如何消除BSSE] liu.jun
行 1: 行 1:
-====== ADF中如何消除BSSE ======+====== ADF中如何计算、消除BSSE ======
 =====BSSE的含义===== =====BSSE的含义=====
 简单的说,考虑BSSE的原因,就是计算结合能的时候,需要统一基函数,这样结合能定义上才更严格。 简单的说,考虑BSSE的原因,就是计算结合能的时候,需要统一基函数,这样结合能定义上才更严格。
行 15: 行 15:
 我们用H2和苯分子之间的BSSE来举例: 我们用H2和苯分子之间的BSSE来举例:
  
-1,首先需要对苯+$H_2$的复合体系进行结构优化,几何结构优化的使用可以参见[[adf:geoopt2020]];+1,首先需要对苯+H<sub>2</sub>的复合体系进行结构优化,几何结构优化的使用可以参见[[adf:geoopt2020]];
  
 2,基于优化好的复合体系的分子结构,先计算该符合体系的单点能(*logfile尾部的bond energy或*.out中的total bonding energy),参数设置参见[[adf:homolumo2020]]; 2,基于优化好的复合体系的分子结构,先计算该符合体系的单点能(*logfile尾部的bond energy或*.out中的total bonding energy),参数设置参见[[adf:homolumo2020]];
  
-3,如下图所示,计算$H_2$单体的能量(需要将苯设置为Ghost):+3,如下图所示,计算H<sub>2</sub>单体的能量(需要将苯设置为Ghost):
  
 {{ adf:2020bsse01.png?700 }} {{ adf:2020bsse01.png?700 }}
  
-然后参数设置(如基组、泛函等等)与2一致,计算单点能。这样得到的单点能,就是$H_2$的单点能。因为基函数包含了$H_2$的基函数,也包含苯的基函数,但没有苯的电子、原子核。+然后参数设置(如基组、泛函等等)与2一致,计算单点能。这样得到的单点能,就是H<sub>2</sub>的单点能。因为基函数包含了H<sub>2</sub>的基函数,也包含苯的基函数,但没有苯的电子、原子核。
  
 4,类似地,计算苯单体的单点能能量(需要将H2设置为Ghost) 4,类似地,计算苯单体的单点能能量(需要将H2设置为Ghost)
行 29: 行 29:
 {{ adf:2020bsse02.png?700 }} {{ adf:2020bsse02.png?700 }}
  
-然后参数设置(如基组、泛函等等)与2一致,计算单点能。这样得到的单点能,就是苯的单点能。因为基函数包含了苯的基函数,也包含$H_2$的基函数,但没有$H_2$的电子、原子核。+然后参数设置(如基组、泛函等等)与2一致,计算单点能。这样得到的单点能,就是苯的单点能。因为基函数包含了苯的基函数,也包含H<sub>2</sub>的基函数,但没有H<sub>2</sub>的电子、原子核。
  
-5,如此得到的复合体系的总能量(第2步的单点能)减去单体的能量(即3,4得到的单点能),就是消除BSSE之后的分子间的结合能。+5,如此得到的复合体系的总能量(第2步的单点能)减去单体的能量(即3,4得到的单点能),就是消除BSSE之后的分子间的**结合能**
 <color lightgrey>如果第3、4步,如果对应的原子不是被设置为Ghost,而是直接删除,那么第2步的单点能,减去3、4步单点能,得到的,就是包含BSSE的分子间的结合能。</color> <color lightgrey>如果第3、4步,如果对应的原子不是被设置为Ghost,而是直接删除,那么第2步的单点能,减去3、4步单点能,得到的,就是包含BSSE的分子间的结合能。</color>
  
-AMS软件提供**免费试用**(一般为一个月),试用申请方式参考:[[adf:trial|]]**+AMS软件提供**免费试用**,试用申请方式参考:[[adf:trial|]]**
adf/bsse2020.1606129695.txt.gz · 最后更改: 2020/11/23 19:08 由 liu.jun

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