adf:atomstooclose
差别
这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
| adf:atomstooclose [2023/11/28 17:22] – [情况一：一开始没有进行任何MD计算，就出现该报错] liu.jun | adf:atomstooclose [2024/01/21 23:10] (当前版本) – [情况二：MD一定步数后，出现该报错] liu.jun | ||
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| 行 12: | 行 12: | ||
| 修改模拟条件，避免该偶然事件（原子剧烈碰撞导致原子距离过近）：修改分子个数、模拟条件如温度等。另外可以参考建议：[[adf: | 修改模拟条件，避免该偶然事件（原子剧烈碰撞导致原子距离过近）：修改分子个数、模拟条件如温度等。另外可以参考建议：[[adf: | ||
| - | 另外，如果体系温度很高，例如4000K甚至10000K，步长设置需要比0.25fs小，否则会导致原子在1个step，就运动到与另一个原子相近的地方，而没有及时更新受力情况，从而导致atoms too close的情况。 | + | **如果体系温度很高，例如4000K甚至10000K，步长设置需要比0.25fs小**，否则会导致原子在1个step，就运动到与另一个原子相近的地方，而没有及时更新受力情况，从而导致atoms too close的情况。 |
| ====检查atoms too close原因==== | ====检查atoms too close原因==== | ||
| 为了更清楚的知道出现atoms too close的原因，我们可以检查一下动画。在*.out尾部会有具体报错信息，展示是哪两个原子出现了这种情况，例如： | 为了更清楚的知道出现atoms too close的原因，我们可以检查一下动画。在*.out尾部会有具体报错信息，展示是哪两个原子出现了这种情况，例如： | ||
adf/atomstooclose.1701163351.txt.gz · 最后更改: 2023/11/28 17:22 由 liu.jun