atk:通过命令行方式手动提交atk计算
差别
这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版上一修订版两侧同时换到之后的修订记录 | ||
| atk:通过命令行方式手动提交atk计算 [2017/09/16 11:41] – [在Linux单机上并行计算] fermi | atk:通过命令行方式手动提交atk计算 [2021/04/26 17:21] – [并行提交脚本设置] dong.dong | ||
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| 行 1: | 行 1: | ||
| - | ====== 通过命令行方式手动提交ATK计算 ====== | + | ====== 通过命令行方式手动提交QuantumATK计算 ====== |
| ===== 运行串行计算 ===== | ===== 运行串行计算 ===== | ||
| 行 13: | 行 13: | ||
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| - | <WRAP center important | + | <WRAP center important |
| ==== 注意 ==== | ==== 注意 ==== | ||
| - | 在单机上使用MPI并行可能和MKL的多线程并行互相干扰，降低并行效率。应使用环境变量 MKL_NUM_THREADS=1 MKL_DYNAMIC=FALSE | + | * 在单机上使用MPI并行可能和MKL的多线程并行互相干扰，降低并行效率。应使用环境变量 MKL_NUM_THREADS=1 MKL_DYNAMIC=FALSE 将动态多线程功能关闭。 |
| - | 将动态多线程功能关闭。 | + | |
| - | 2017版本以后，ATK使用内置Intel MPI并行，可更好的管理MPI和OpenMP并行，敬请测试。 | + | |
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| ===== 在Linux计算机集群上并行计算 ===== | ===== 在Linux计算机集群上并行计算 ===== | ||
| 行 50: | 行 49: | ||
| ## 通知计算时需要访问的License server所在位置或自动搜索 | ## 通知计算时需要访问的License server所在位置或自动搜索 | ||
| - | export | + | export |
| cd $PBS_O_WORKDIR | cd $PBS_O_WORKDIR | ||
| 行 124: | 行 123: | ||
| </ | </ | ||
| + | <WRAP center important 100%> | ||
| ==== 说明 ==== | ==== 说明 ==== | ||
| 以上脚本的修改需要根据具体的集群hosts文件中的主机名规律进行调试。 | 以上脚本的修改需要根据具体的集群hosts文件中的主机名规律进行调试。 | ||
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atk/通过命令行方式手动提交atk计算.txt · 最后更改: 2021/04/26 17:25 由 dong.dong