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atk:构建ag_100_和au_111_界面模型

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atk:构建ag_100_和au_111_界面模型 [2018/05/10 11:00] – [构建 Ag(100)-Au(111) 晶体] xie.congweiatk:构建ag_100_和au_111_界面模型 [2018/05/22 10:13] – [构建 Ag(100) 和 Au(111) 晶体] fermi
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 ====== 构建 Ag(100)-Au(111) 界面模型 ====== ====== 构建 Ag(100)-Au(111) 界面模型 ======
  
-**VNL:界面**+**VNL:界面建模工具**
  
-在该教程中,您将学会怎样使用界面构建器。您将在 Ag(100) 和 Au(100) 之间建立界面。+在该教程中,您将学会怎样使用材料界面建模工具,构建 Ag(100) 和 Au(100) 之间界面。
  
 假设您已经熟悉了 VNL 的基本功能。 假设您已经熟悉了 VNL 的基本功能。
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 {{ :atk:screenshot1.png?direct&700 |}} {{ :atk:screenshot1.png?direct&700 |}}
-===== 构建 Ag(100)-Au(111) 晶体 =====+===== 构建 Ag(100) 和 Au(111) 表面 =====
  
   - 打开 **Surface (Cleave)** 工具。   - 打开 **Surface (Cleave)** 工具。
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   - 点击 **Finish**。   - 点击 **Finish**。
  
-对金的晶体结构做同样的操作,但将其沿111方向切割。+对金的晶体结构做同样的操作,但将其沿 (111方向切割。
  
 {{ :atk:screenshot2.png?direct&600 |}} {{ :atk:screenshot2.png?direct&600 |}}
 ===== 构建界面 ===== ===== 构建界面 =====
  
-现在您已经构造了Ag(100)和Au(111)的超胞结构,下一步就是让它们结合成一个界面。为了达到这个目的,我们要打开面板栏Builders分组里的**Interface**插件。它有两个位置,分别将Ag(100)和Au(111)晶体放在第一个和第二个位置上。+现在您已经构造了 Ag(100) 和 Au(111) 的超胞结构,下一步就是让它们结合成一个界面。为了达到这个目的,我们要打开面板栏 Builders 分组里的 **Interface** 插件。它有两个位置,分别将 Ag(100) 和 Au(111) 晶体放在第一个和第二个位置上。
  
-VNL会搜索这两个表面间所有可能的重复次数和旋转操作,以寻找到有最小应变的公共超胞。打开**Select Surface Cells**菜单,上方两张图显示了两晶体的被选定面。下方左侧图上有一些蓝色的圆点,每个点都代表着一个两晶体的公共超胞。+VNL 会搜索这两个表面间所有可能的重复次数和旋转操作,以寻找到有最小应变的公共超胞。打开 **Select Surface Cells** 菜单,上方两张图显示了两晶体的被选定面。下方左侧图上有一些蓝色的圆点,每个点都代表着一个两晶体的公共超胞。
  
-现在我们要来调整用于匹配晶体的算法。为了达到这一目的,需要打开**Set Matching Parameters**菜单。在这个菜单里,可以选择每个单元格重复的次数和扫描到的角度来形成匹配。增大n<sup>max</sup>和m<sup>max</sup>的值到8可以用较小的应力搜索到较大的超胞。然后点击OK。+现在我们要来调整用于匹配晶体的算法。为了达到这一目的,需要打开 **Set Matching Parameters** 菜单。在这个菜单里,可以选择每个单元格重复的次数和扫描到的角度来形成匹配。增大 n<sup>max</sup> 和 m<sup>max</sup> 的值到 8 可以用较小的应力搜索到较大的超胞。然后点击 OK。
  
 {{ :atk:screenshot3.png?direct&450 |}} {{ :atk:screenshot3.png?direct&450 |}}
  
-现在重新计算所有匹配的晶体。选择最接近左下角的蓝点,该点是具有较小超胞和较小应力的最优解。这个超胞包含38个原子,只有0.47%的平均应力。点击Apply。+现在重新计算所有匹配的晶体。选择最接近左下角的蓝点,该点是具有较小超胞和较小应力的最优解。这个超胞包含 38 个原子,只有 0.47% 的平均应力。点击 Apply。
  
 {{ :atk:screenshot4.png?direct&550 |}} {{ :atk:screenshot4.png?direct&550 |}}
  
-下一步,设定两晶体的相对位置。打开主界面Builder窗口的**Shift Surface**菜单。此处,既可以手动调整晶体间的相对位置,还可以用ATK-ForceField计算器模拟最佳距离。+下一步,设定两晶体的相对位置。打开主界面 Builder 窗口的 **Shift Surface** 菜单。此处,既可以手动调整晶体间的相对位置,还可以用 
 + ATK-ForceField 计算器模拟最佳距离。
  
-  - 选择“EAM_Zhou_2004”势。 +  - 选择 “EAM_Zhou_2004” 势。 
-  - 勾选**Calculate energy**选项框。 +  - 勾选 **Calculate energy** 选项框。 
-  - 点击**Calculate displacement**。+  - 点击 **Calculate displacement**。
  
 {{ :atk:screenshot5.png?direct&550 |}} {{ :atk:screenshot5.png?direct&550 |}}
行 56: 行 57:
 <WRAP center important 100%> <WRAP center important 100%>
 === 注意 === === 注意 ===
-对于2017之前版本的ATK,**ATK-ForceField**计算器可以在在名为**ATK-Classical**的分类下找到。+对于 2017 之前版本的 ATK, **ATK-ForceField** 计算器可以在在名为 **ATK-Classical** 的分类下找到。
 </WRAP> </WRAP>
  
-选择**Shift Surfaces**菜单,返回到主界面窗口。使用按钮增加5个银层和3个金层。检查一下,现在界面的左侧有7层,右侧有6层(提示:您可以用快捷键Ctrl+r调整图形窗口的大小)。点击**Create**生成结构。+选择 **Shift Surfaces** 菜单,返回到主界面窗口。使用按钮增加 5 个银层和 3 个金层。检查一下,现在界面的左侧有 7 层,右侧有 6 层(提示:您可以用快捷键 Ctrl+r 调整图形窗口的大小)。点击 **Create** 生成结构。
  
 {{ :atk:screenshot6.png?direct&700 |}} {{ :atk:screenshot6.png?direct&700 |}}
行 65: 行 66:
 <WRAP center tip 100%> <WRAP center tip 100%>
 === 提示 === === 提示 ===
-您可以在[[https://docs.quantumwise.com/technicalnotes/interface_builder/interface_builder.html#interface-builder|The Interface Builder in VNL]]的技术说明中了解更多Interface Builder的相关信息。+您可以在 [[https://docs.quantumwise.com/technicalnotes/interface_builder/interface_builder.html#interface-builder|The Interface Builder in VNL]] 的技术说明中了解更多 Interface Builder 的相关信息。
 </WRAP> </WRAP>
  
行 72: 行 73:
  
  
-===== 构建器件构形 =====+===== 构建器件构型 =====
  
-最后一步是在界面结构的基础上创建器件构。收起Builders分组,展开Builder面板的**Device Tools**,选择**Device from Bulk**。该工具将尝试通过查找重复匹配来确定电极长度。保持默认值,点击**OK**。现在您已经完成了所有的设置。+最后一步是在界面结构的基础上创建器件构。收起 Builders 分组,展开 Builder 面板的 **Device Tools**,选择 **Device from Bulk**。该工具将尝试通过查找重复匹配来确定电极长度。保持默认值,点击 **OK**。现在您已经完成了所有的设置。
  
-使用**File**菜单或右键单击Stash里的文件将生成的结构保存到文件''Ag_Au_interface.py''中。+使用 **File** 菜单或右键单击 Stash 里的文件将生成的结构保存到文件 ''Ag_Au_interface.py'' 中。
  
 {{ :atk:screenshot7.png?direct&700 |}} {{ :atk:screenshot7.png?direct&700 |}}
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 +===== 参考 =====
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 +  * 英文原文:[[https://docs.quantumwise.com/tutorials/ag_au_interface/ag_au_interface.html|https://docs.quantumwise.com/tutorials/ag_au_interface/ag_au_interface.html]]
 +
atk/构建ag_100_和au_111_界面模型.txt · 最后更改: 2018/06/15 10:15 由 fermi

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