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atk:构建ag_100_和au_111_界面模型 [2018/05/10 11:00] – [构建 Ag(100)-Au(111) 晶体] xie.congwei | atk:构建ag_100_和au_111_界面模型 [2018/05/22 10:13] – [构建 Ag(100) 和 Au(111) 晶体] fermi | ||
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====== 构建 Ag(100)-Au(111) 界面模型 ====== | ====== 构建 Ag(100)-Au(111) 界面模型 ====== | ||
- | **VNL:界面构建器** | + | **VNL:界面建模工具** |
- | 在该教程中,您将学会怎样使用界面构建器。您将在 | + | 在该教程中,您将学会怎样使用材料界面建模工具,构建 Ag(100) 和 Au(100) 之间的界面。 |
假设您已经熟悉了 VNL 的基本功能。 | 假设您已经熟悉了 VNL 的基本功能。 | ||
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- | ===== 构建 Ag(100)-Au(111) | + | ===== 构建 Ag(100) |
- 打开 **Surface (Cleave)** 工具。 | - 打开 **Surface (Cleave)** 工具。 | ||
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- 点击 **Finish**。 | - 点击 **Finish**。 | ||
- | 对金的晶体结构做同样的操作,但将其沿(111)方向切割。 | + | 对金的晶体结构做同样的操作,但将其沿 |
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===== 构建界面 ===== | ===== 构建界面 ===== | ||
- | 现在您已经构造了Ag(100)和Au(111)的超胞结构,下一步就是让它们结合成一个界面。为了达到这个目的,我们要打开面板栏Builders分组里的**Interface**插件。它有两个位置,分别将Ag(100)和Au(111)晶体放在第一个和第二个位置上。 | + | 现在您已经构造了 Ag(100) 和 Au(111) 的超胞结构,下一步就是让它们结合成一个界面。为了达到这个目的,我们要打开面板栏 Builders 分组里的 **Interface** 插件。它有两个位置,分别将 Ag(100) 和 Au(111) 晶体放在第一个和第二个位置上。 |
- | VNL会搜索这两个表面间所有可能的重复次数和旋转操作,以寻找到有最小应变的公共超胞。打开**Select Surface Cells**菜单,上方两张图显示了两晶体的被选定面。下方左侧图上有一些蓝色的圆点,每个点都代表着一个两晶体的公共超胞。 | + | VNL 会搜索这两个表面间所有可能的重复次数和旋转操作,以寻找到有最小应变的公共超胞。打开 **Select Surface Cells** 菜单,上方两张图显示了两晶体的被选定面。下方左侧图上有一些蓝色的圆点,每个点都代表着一个两晶体的公共超胞。 |
- | 现在我们要来调整用于匹配晶体的算法。为了达到这一目的,需要打开**Set Matching Parameters**菜单。在这个菜单里,可以选择每个单元格重复的次数和扫描到的角度来形成匹配。增大n< | + | 现在我们要来调整用于匹配晶体的算法。为了达到这一目的,需要打开 **Set Matching Parameters** 菜单。在这个菜单里,可以选择每个单元格重复的次数和扫描到的角度来形成匹配。增大 n< |
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- | 现在重新计算所有匹配的晶体。选择最接近左下角的蓝点,该点是具有较小超胞和较小应力的最优解。这个超胞包含38个原子,只有0.47%的平均应力。点击Apply。 | + | 现在重新计算所有匹配的晶体。选择最接近左下角的蓝点,该点是具有较小超胞和较小应力的最优解。这个超胞包含 38 个原子,只有 0.47% 的平均应力。点击 Apply。 |
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- | 下一步,设定两晶体的相对位置。打开主界面Builder窗口的**Shift Surface**菜单。此处,既可以手动调整晶体间的相对位置,还可以用ATK-ForceField计算器模拟最佳距离。 | + | 下一步,设定两晶体的相对位置。打开主界面 Builder 窗口的 **Shift Surface** 菜单。此处,既可以手动调整晶体间的相对位置,还可以用 |
+ | ATK-ForceField 计算器模拟最佳距离。 | ||
- | - 选择“EAM_Zhou_2004”势。 | + | - 选择 “EAM_Zhou_2004” 势。 |
- | - 勾选**Calculate energy**选项框。 | + | - 勾选 **Calculate energy** 选项框。 |
- | - 点击**Calculate displacement**。 | + | - 点击 **Calculate displacement**。 |
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<WRAP center important 100%> | <WRAP center important 100%> | ||
=== 注意 === | === 注意 === | ||
- | 对于2017之前版本的ATK,**ATK-ForceField**计算器可以在在名为**ATK-Classical**的分类下找到。 | + | 对于 2017 之前版本的 ATK, **ATK-ForceField** 计算器可以在在名为 **ATK-Classical** 的分类下找到。 |
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- | 选择**Shift Surfaces**菜单,返回到主界面窗口。使用按钮增加5个银层和3个金层。检查一下,现在界面的左侧有7层,右侧有6层(提示:您可以用快捷键Ctrl+r调整图形窗口的大小)。点击**Create**生成结构。 | + | 选择 **Shift Surfaces** 菜单,返回到主界面窗口。使用按钮增加 5 个银层和 3 个金层。检查一下,现在界面的左侧有 7 层,右侧有 6 层(提示:您可以用快捷键 Ctrl+r 调整图形窗口的大小)。点击 **Create** 生成结构。 |
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<WRAP center tip 100%> | <WRAP center tip 100%> | ||
=== 提示 === | === 提示 === | ||
- | 您可以在[[https:// | + | 您可以在 [[https:// |
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行 72: | 行 73: | ||
- | ===== 构建器件构形 ===== | + | ===== 构建器件构型 ===== |
- | 最后一步是在界面结构的基础上创建器件构形。收起Builders分组,展开Builder面板的**Device Tools**,选择**Device from Bulk**。该工具将尝试通过查找重复匹配来确定电极长度。保持默认值,点击**OK**。现在您已经完成了所有的设置。 | + | 最后一步是在界面结构的基础上创建器件构型。收起 Builders 分组,展开 Builder 面板的 **Device Tools**,选择 **Device from Bulk**。该工具将尝试通过查找重复匹配来确定电极长度。保持默认值,点击 **OK**。现在您已经完成了所有的设置。 |
- | 使用**File**菜单或右键单击Stash里的文件将生成的结构保存到文件'' | + | 使用 **File** 菜单或右键单击 Stash 里的文件将生成的结构保存到文件 '' |
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