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atk:使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤

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atk:使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤 [2016/01/14 00:26] fermiatk:使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤 [2016/09/28 08:39] – [输入文件] nie.han
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 === 计算脚本的详细度 === === 计算脚本的详细度 ===
  
-在设置计算并保存脚本时,可以有两个详细程度“”和“Show Default”,它们的区别是: +在设置计算并保存脚本时,可以有两个详细程度“Minimal”和“Show Default”,它们的区别是: 
-  * “”:仅在脚本中写入用户手动调整的、与默认值不同的参数; +  * “**Minimal**”:仅在脚本中写入用户手动调整的、与默认值不同的参数; 
-  * “Show Default”:将所有计算中涉及的参数与默认值都写入脚本,方便用户了解默认值的情况。+  * “**Show Default**”:将所有计算中涉及的参数与默认值都写入脚本,方便用户了解默认值的情况。
  
-在计算的效果上,这两种脚本不会有差别。+在计算的效果上,这两种方法生成的脚本不会有差别。
  
 ==== 输出文件 ==== ==== 输出文件 ====
  
-VNL-ATK将所有计算结果的详细数据都保存在一个NetCDF文件中,文件的扩展名默认为“''*.nc''”。+VNL-ATK将所有计算结果的详细数据都保存在一个NetCDF文件中,文件的扩展名默认为“''.nc''”。
  
 === 如何读取nc文件中的数据 === === 如何读取nc文件中的数据 ===
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 ===== 在已有计算的基础上进一步分析其他性质 ===== ===== 在已有计算的基础上进一步分析其他性质 =====
  
-如果用户已经对某一模型进行过一些计算,而在之后的研究中想使用同样的方法继续分析其他的性质,则可以选择使用“''Analysis from File''”的功能,不必重新设置计算。这样做有几个好处(尤其是对DFT计算而言): +<WRAP center round important 100%> 
-  * **不再需要Master License**:在已有计算结果文件基础上,计算分析其他性质不需要Master License。这样用户始终可以将珍贵的Master License用于新的计算。实际上,**在整个DFT计算的过程中,只有包含自洽过程的计算步骤才需要Master License** +从2016版开始,所有分析计算都将消耗一个master,用户需要在能获得master license的机器上进行计算。与此相对的,进行NEB、IVCurve等多个并行的自洽的计算作业不再需要多个master,而是只需要1个master,并使用多个slave并行,这将大大优化计算license使用效率。 
-  * **可以在客户端的VNL上完成**:由于不需要Master license,而且分析计算的计算量通常不大,用户可以在安装有VNL图形界面的本地机器上完成计算,不必提交到服务器上排队,更加便捷。**用户申请的学术免费版VNL图形界面也可以进行这种分析计算。**+</WRAP> 
 + 
 +如果用户已经对某一模型进行过一些计算,而在之后的研究中想使用同样的方法继续分析其他的性质,则可以选择使用“''Analysis from File''”的功能,不必重新设置计算。这样做可以节省自洽电子密度的计算。 
  
  
  
atk/使用vnl-atk进行计算模拟的一般操作步骤.txt · 最后更改: 2018/08/12 16:09 由 fermi

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