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adf:vdd [2016/08/14 15:56] – [如何使用VDD电荷,分析片段相互作用时电荷的转移情况] liu.jun | adf:vdd [2017/04/14 16:51] – [ADF中的VDD] liu.jun | ||
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- | ======如何使用VDD电荷,分析片段相互作用时的电荷转移====== | + | ======如何使用VDD电荷,分析片段相互作用时的电荷迁移====== |
======VDD电荷物理含义====== | ======VDD电荷物理含义====== | ||
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因此: | 因此: | ||
* 要计算分子、二聚体、三聚体……中每个原子的净电荷,就不需要设置片段,直接进行单点计算,SCM LOGO> View > properties > Atom Info > VDD Charge即对应该原子的带电量——实际上此时是以单个原子为片段的,也就是对比(超)分子中每个原子的净电荷与这些原子孤立存在的时候的净电荷(约为0,之所以是“约”,是因为空间划分的缘故——不是整个无限大的空间)之间的差值,这样当然就是(超)分子中每个原子的净电荷 | * 要计算分子、二聚体、三聚体……中每个原子的净电荷,就不需要设置片段,直接进行单点计算,SCM LOGO> View > properties > Atom Info > VDD Charge即对应该原子的带电量——实际上此时是以单个原子为片段的,也就是对比(超)分子中每个原子的净电荷与这些原子孤立存在的时候的净电荷(约为0,之所以是“约”,是因为空间划分的缘故——不是整个无限大的空间)之间的差值,这样当然就是(超)分子中每个原子的净电荷 | ||
- | * 要计算片段组合成二聚体、三聚体“之前”与“之后”,片段中原子的净电荷变化量,那么进行标准的片段分析,具体参考[[adf: | + | * 要计算片段组合成二聚体、三聚体“之前”与“之后”,片段中原子的净电荷变化量,那么进行标准的片段分析,具体参考[[adf: |
- | * 基于上述原因,一般使用第三项进行分析,第一、二项很少使用 | + | * 基于上述原因,一般使用VDD Charge。VDD(SCF term)、VDD(initial term)使用不太多。 |