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adf:vandervaarssurfacepotential [2023/06/13 14:00] – liu.jun | adf:vandervaarssurfacepotential [2023/06/14 15:40] (当前版本) – [结果查看] liu.jun | ||
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- | ======如何显示范德华表面的静电势分布====== | + | ======如何显示分子体系范德华表面的静电势分布====== |
首先,范德华表面的定义,如果参考文献(J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, | 首先,范德华表面的定义,如果参考文献(J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, | ||
- | 然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算,均可给出该性质。单点计算参数设置,参考:[[adf: | + | 然后在该曲面显示静电势或其他函数均可。任何一个单点计算,均可给出该性质。本文是关于ADF模块针对分子的计算,单点计算参数设置,参考:[[adf: |
+ | ======结果查看===== | ||
操作方法:SCM LOGO → View → Add → Isosurface: | 操作方法:SCM LOGO → View → Add → Isosurface: | ||
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注意: | 注意: | ||
- Density SCF,指电子云密度,0.001即该曲面为电子云密度值为0.001 a.u.的曲面 | - Density SCF,指电子云密度,0.001即该曲面为电子云密度值为0.001 a.u.的曲面 | ||
- | - Culoumb potential SCF即静电势,后面两个方框内的值为值的范围,为程序自动计算得出,为了显示更对称,用户可以将数值改为±对称,这样白色的位置即静电势为0 | + | - Culoumb potential SCF即静电势,后面两个方框内的值为该曲面上静电势的范围,为程序自动计算得出 |
- 可以点击左下角第一个选项,选择Show details,设置Opacity的值为40~50左右,该数值为透明度,0表示完全透明,100表示完全不透明 | - 可以点击左下角第一个选项,选择Show details,设置Opacity的值为40~50左右,该数值为透明度,0表示完全透明,100表示完全不透明 | ||
- 勾选最右侧的Bar,则显示色条 | - 勾选最右侧的Bar,则显示色条 |