这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版后一修订版两侧同时换到之后的修订记录 | ||
adf:submitfragment_lsf [2019/12/09 17:27] – [BAND模块] liu.jun | adf:submitfragment_lsf [2022/07/28 12:29] – [ADF模块] liu.jun | ||
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行 4: | 行 4: | ||
- 保存任务时候,会生成N+1个任务,也就是有N个片段run文件,和1个超分子计算的run文件; | - 保存任务时候,会生成N+1个任务,也就是有N个片段run文件,和1个超分子计算的run文件; | ||
- 先分别提交N个片段计算的任务,和普通的任务提交方式一样; | - 先分别提交N个片段计算的任务,和普通的任务提交方式一样; | ||
- | - N个片段计算完成,得到TAPE21文件(或者*.t21文件),之后再提交整个体系计算的run文件,但需要事先对该文件进行修改: | + | - N个片段计算完成,得到*.results/ |
- | 如果正确地设置了片段,那么超分子计算的run文件,应该有类似如下的部分: | + | 在Windows中如果正确地设置了片段,那么整个体系计算的run文件,应该有类似如下的部分: |
fragments | fragments | ||
- | CO CO.t21 | + | CO CO.rkf |
- | Ni Ni.t21 | + | Ni Ni.rkf |
end | end | ||
| | ||
- | 其中CO、Ni就是片段的名字,**但是请注意**: | ||
- | <color blue> | + | 在Linux系统中提交作业,软件不能自动改名字,因此用户需要手动修改脚本,指向片段的*.results/adf.rkf(Linux上提交作业,默认生成的是ams.results文件夹,建议用户自行改名)文件,例如: |
- | + | ||
- | {{: | + | |
- | + | ||
- | 至于后面的*.t21的命名,则无所谓。但需要与设置的片段确实对应上! | + | |
- | + | ||
- | 如果有N个片段,fragments与end之间就会有N行。 | + | |
- | + | ||
- | 后面的*.t21就是前面计算完毕之后得到的对应的片段的*.t21文件。但在Linux中提交的时候,事实上需要将*.t21的路径也指明,否则程序并不知道你事先的片段计算得到的*.t21在什么地方。 | + | |
- | + | ||
- | 比如CO.t21在/home/ | + | |
fragments | fragments | ||
- | CO / | + | CO / |
- | Ni / | + | Ni / |
end | end | ||
| | ||
行 34: | 行 23: | ||
=====BAND模块===== | =====BAND模块===== | ||
- | 与ADF模块类似,不过BAND对应的文件名不是*.t21而是*.results文件夹内的band.rkf文件。用户可以在Windows生成的run文件中,直接添加*。results/ | + | 与ADF模块类似,不过BAND对应的文件是*.results文件夹内的band.rkf文件。用户可以在Windows生成的run文件中,直接添加*.results/ |
< | < | ||
Fragment | Fragment |