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adf:pesofreaxff [2020/11/27 17:23] – 创建 liu.jun | adf:pesofreaxff [2020/11/27 17:51] – [ReaxFF-PES:势能面扫描] liu.jun | ||
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======ReaxFF-PES:势能面扫描====== | ======ReaxFF-PES:势能面扫描====== | ||
+ | 势能面扫描,是AMS驱动的,各个模块使用起来,除了各个方法本身的参数(也就是Main窗口的设置)之外,其他参数设置是一样的。因此其他模块的PES使用,也可以参考本教程。 | ||
+ | =====一、简单的势能面扫描===== | ||
+ | ====参数设置==== | ||
+ | 简单的势能面扫描,任务类型选择PES Scan,并选择合适的力场: | ||
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+ | 选中要扫描的键长或键角、二面角。注意,对键角、二面角,选择原子需要按顺序选择,例如对键角而言,第二个被选中的原子是角的顶点。然后右侧选择distance(键长)或angle(键角)、dihedral(二面角)前面的加号,然后设置扫描范围: | ||
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+ | SC-1表示第一个扫描条件,设置该扫描条件,扫描的点数为10。如果有多个扫描条件,也可以类似设置: | ||
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+ | 保存并运行任务。 | ||
+ | ====结果查看==== | ||
+ | SCM - Movie即可看到能量变化曲线,不过是三条曲线(能量、梯度、梯度均值),Graph - Delete graph删除曲线,然后Graph - Energy,即可只显示能量变化曲线: | ||
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+ | =====二、多维的势能面扫描===== | ||
+ | ====参数设置==== | ||
+ | 与单个条件类似设置,例如: | ||
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+ | 分别设置多个扫描条件,以及扫描的点的个数: | ||
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+ | ====结果查看==== | ||
+ | SCM - Movie,右下角可以看到二维势能面: | ||
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+ | 例如本例,xy轴分别为两个扫描条件,总共扫描了10*10=100个点,z轴为能量的大小,用曲面显示能量大小,同时用颜色表达能量的大小。 | ||
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