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adf:periodicity [2024/04/02 18:48] – [7,避免误解] liu.jun | adf:periodicity [2024/04/03 17:25] (当前版本) – [周期边界条件] liu.jun | ||
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======周期边界条件====== | ======周期边界条件====== | ||
+ | =====重要性===== | ||
+ | 这个知识点,对分子动力学模拟、晶体DFT计算,是必备基础知识,这个点不掌握,后续导致无穷无尽的理解方面的问题,模型的错乱问题。如果这个知识点不懂,建议不要进行分子动力学模拟、晶体的DFT计算,因为你在浪费自己和他人的时间! | ||
+ | =====前言===== | ||
有一类材料,比如NaCl单晶,也许在宏观上它是一个小颗粒,但是在微观上,几乎就是以一个重复单元,在三个维度上重复约阿伏伽德罗常数那么多次,对微观机理研究来说,就可以认为是无限重复的。在材料的性质研究中,人们发现材料的很多方面的宏观、微观、电子结构性质,只与其重复单元的状况有关,而与重复具体是阿伏伽德罗常数次,还是阿伏伽德罗常数的2倍那么多次,并没有太大关系。 | 有一类材料,比如NaCl单晶,也许在宏观上它是一个小颗粒,但是在微观上,几乎就是以一个重复单元,在三个维度上重复约阿伏伽德罗常数那么多次,对微观机理研究来说,就可以认为是无限重复的。在材料的性质研究中,人们发现材料的很多方面的宏观、微观、电子结构性质,只与其重复单元的状况有关,而与重复具体是阿伏伽德罗常数次,还是阿伏伽德罗常数的2倍那么多次,并没有太大关系。 | ||
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即,在Cell边界上的“棍”是指该Cell中的原子,和相邻Cell中的原子是成键的,但由于周期性的原因,只显示一个Cell的原子即可,因此相邻Cell的原子不再显示,而相邻周期的原子,实际上就是本Cell平移一个周期的位置上的那个原子。而此除显示为虚影,就是告诉用户,虚影处是有原子的,但是不显示,因为在隔壁Cell。 | 即,在Cell边界上的“棍”是指该Cell中的原子,和相邻Cell中的原子是成键的,但由于周期性的原因,只显示一个Cell的原子即可,因此相邻Cell的原子不再显示,而相邻周期的原子,实际上就是本Cell平移一个周期的位置上的那个原子。而此除显示为虚影,就是告诉用户,虚影处是有原子的,但是不显示,因为在隔壁Cell。 | ||
- | =====8,典型错误==== | + | =====8,典型错误操作==== |
如果充分理解以上,则不可能犯下面的错误: | 如果充分理解以上,则不可能犯下面的错误: | ||
行 64: | 行 66: | ||
跨越Cell边界的分子,也是类似! | 跨越Cell边界的分子,也是类似! | ||
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+ | 简而言之,直接扩大Cell,令跨越Cell边界的分子碎裂,令跨越Cell边界的二维材料被切割开,令跨越Cell边界的晶体,成为了团簇。 |