这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版 | ||
adf:onlyatomscompleted [2016/12/29 15:16] – liu.jun | adf:onlyatomscompleted [2020/10/17 19:06] (当前版本) – [问题检测] liu.jun | ||
---|---|---|---|
行 1: | 行 1: | ||
====== 故障:只完成原子计算,不进行分子计算 ====== | ====== 故障:只完成原子计算,不进行分子计算 ====== | ||
=====前言===== | =====前言===== | ||
+ | ADF的计算过程是:首先用Slater基组计算原子,得到原子的轨道,用原子的轨道作为基组,计算整个分子。因此在logfile里面,可以看到,先完成原子的计算,然后列出分子的坐标,然后计算整个分子。具体如下: | ||
=====问题检测===== | =====问题检测===== | ||
行 20: | 行 20: | ||
原子,内容与上面类似。 | 原子,内容与上面类似。 | ||
- | 原子计算结束后,开始计算整个分子。正常的情况应该是出现类似如下信息: | + | 原子计算结束后,开始计算整个分子。正常的情况应该是出现类似如下信息(本例是进行结构优化): |
< | < | ||
< | < | ||
行 32: | 行 32: | ||
| | ||
| | ||
- | 这就开始了分子的计算。 | + | 这里列出了要计算的整个分子的坐标,之后开始了分子的计算。 |
- | 但如果这部分内容一直不能开始,在命令行也检查不到adf.exe的进程,那么这很可能是由于无密码通讯设置不完善造成。 | + | 但如果这部分内容一直不能开始,也检查不到adf.exe的进程,那么这很可能是由于无密码通讯设置不完善造成。 |
+ | |||
+ | **对于Linux:** | ||
一般在集群或单个服务器(联网或不联网都是如此),在节点间切换,例如从node01节点切换到node02节点,可以在node01的命令行输入ssh node02回车。然后就会登陆到node02节点,正常情况下,是不需要输入密码的,系统管理员一般而言,已经完成了免密码登录的配置;如果是单个服务器,例如ip是192.168.1.100,那么自己切换到自己,应该是不需要输入密码的——即如果当前在192.168.1.100服务器上,在命令行执行ssh 192.168.1.100回车,之后是不需要输入密码的。 | 一般在集群或单个服务器(联网或不联网都是如此),在节点间切换,例如从node01节点切换到node02节点,可以在node01的命令行输入ssh node02回车。然后就会登陆到node02节点,正常情况下,是不需要输入密码的,系统管理员一般而言,已经完成了免密码登录的配置;如果是单个服务器,例如ip是192.168.1.100,那么自己切换到自己,应该是不需要输入密码的——即如果当前在192.168.1.100服务器上,在命令行执行ssh 192.168.1.100回车,之后是不需要输入密码的。 | ||
行 40: | 行 42: | ||
倘若这种设置没有完善,在节点切换时,需要输入密码,那么就会导致计算不能进行(能够完成原子计算部分,而分子计算部分则一直不开始,也不结束,无论等多久都没有任何反应)。 | 倘若这种设置没有完善,在节点切换时,需要输入密码,那么就会导致计算不能进行(能够完成原子计算部分,而分子计算部分则一直不开始,也不结束,无论等多久都没有任何反应)。 | ||
+ | **对于Windows:** | ||
+ | |||
+ | 往往是杀毒软件把ADF并行计算禁止了,这在安装过程中,防火墙会弹出提示,如果不理会,则会自动禁止。WSASocket failed, error 10060报错,就是由于防火墙引起的,关闭防火墙就正常工作了。或者把AMS进程加入到白名单。 | ||
=====解决方式(Linux系统)===== | =====解决方式(Linux系统)===== | ||