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adf:nics

差别

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两侧同时换到之前的修订记录前一修订版
后一修订版
前一修订版
后一修订版两侧同时换到之后的修订记录
adf:nics [2019/12/06 23:48] liu.junadf:nics [2020/11/18 22:08] – [保存该文件后,运行该文件] liu.jun
行 1: 行 1:
 ====== 如何计算Nucleus Independent Chemical Shifts====== ====== 如何计算Nucleus Independent Chemical Shifts======
-1,将[[adf:geoopt|优化]]好的结构导入ADFinput,并依次设置参数如下图所示:+=====参数设置 ===== 
 +将[[adf:geoopt2019|优化]]好的结构导入ADFinput,并依次设置参数如下图所示:
  
 {{ adf:nics01.jpg?650 }} {{ adf:nics01.jpg?650 }}
行 21: 行 22:
 3,结果查看: 3,结果查看:
  
-在生成的logfile文件末尾我们可以看到我们需要计算的个点的化学位移屏蔽量:+在生成的logfile文件末尾我们可以看到我们需要计算的个点的NMR屏蔽量(即Gh(1))
  
-{{adf:nics07.jpg|}}+<code> 
 +<Dec06-2019> <23:40:07>  NMR Shielding ADF-GUI atom   P(1):         162.70 ppm 
 +<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGP 
 +<Dec06-2019> <23:40:07>  >>>> ZSGD 
 +<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(2):         175.97 ppm 
 +<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP 
 +<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD 
 +<Dec06-2019> <23:40:08>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(3):         175.99 ppm 
 +<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGP 
 +<Dec06-2019> <23:40:08>  >>>> ZSGD 
 +<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding ADF-GUI atom   F(4):         175.97 ppm 
 +<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGP 
 +<Dec06-2019> <23:40:09>  >>>> ZSGD 
 +<Dec06-2019> <23:40:09>  NMR Shielding  Gh(1):           0.84 ppm 
 +</code>
  
-在out文件末尾也可以看类似更详细内容+注意屏蔽量是一个相对量。某个原子NMR屏蔽量,与一个标准原子的位移量实验值进行对准后,得该点化学位移量
  
-{{adf:nics08.jpg|}}+$δ_i =σ_{example} + δ_{example- σ_i$ 
 +其中 
 +  * $δ_i$是平移后的化学位移值,可以与实验值直接比较 
 +  * $σ_{example}$是样本计算NMR屏蔽量值 
 +  * $δ_{example}$是样本实验NMR化学位移值 
 +  * $σ_i$是平移前的计算NMR屏蔽值
  
-4,NICS: +在out文件的末尾也可以看到类似更详细内容,包括顺磁、逆磁、总和: 
-Ghost可以作是一个中子,因此该点NICS的值为该点的屏蔽张量中的各向同性部分乘以-1——也就是logfile中,该点的NMR Shielding值乘以-1+<code> 
 +****  G H O S T : Gh(1) 
 +  
 +                 COORDINATES (ANGSTROMS)  
 +                 ------------------------------------- 
 +                       1.5271     -0.3214     -0.0960 
 + Internal NMR numbering of atoms: Gh(5) 
 +  
 +  
 +===  PARAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm) 
 +  
 +                     paramagnetic b^(1) =      0.000 
 +                     paramagnetic u^(1) =    -29.814 
 +                     paramagnetic s^(1) =     20.010 
 +                     paramagnetic gauge =      8.049 
 +          ------------------------------------------ 
 +                     total paramagnetic =     -1.756 
 +          ------------------------------------------ 
 +  
 +  
 +===  DIAMAGNETIC ISOTROPIC NMR SHIELDINGS (ppm) 
 +  
 +                       diamagnetic core =      0.000 
 +                    diamagnetic valence =      2.596 
 +          ------------------------------------------ 
 +                      total diamagnetic =      2.596 
 +          ------------------------------------------ 
 +  
 +  
 +===  TOTAL ISOTROPIC NMR SHIELDING (ppm) 
 +  
 +          ------------------------------------------ 
 +              total isotropic shielding =      0.840 
 +          ------------------------------------------ 
 +</code>
  
-+=====NICS===== 
 +Ghost可以被看作是一个中子,因此该点的NICS的值为该点的屏蔽张量中的各向同性值(也就是logfile中该点的NMR Shielding值)乘以-1
  
-ADF软件提供**免费试用**(一般为一个月),试用申请方式参见**费米科技维基百科:[[adf:trial|]]**+AMS提供**免费试用**(一般为一个月),试用申请方式参:[[adf:trial|]]**

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