这里会显示出您选择的修订版和当前版本之间的差别。
两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版后一修订版两侧同时换到之后的修订记录 | ||
adf:nci [2019/12/07 23:49] – liu.jun | adf:nci [2019/12/31 20:16] – liu.jun | ||
---|---|---|---|
行 1: | 行 1: | ||
- | ======非键作用NCI: Non-Covalent Interactions====== | + | ======非共价作用NCI: Non-Covalent Interactions====== |
=====原理===== | =====原理===== | ||
RDG(Reduced Density Gradient):s = 1/ | RDG(Reduced Density Gradient):s = 1/ | ||
行 19: | 行 19: | ||
在ADF模块的基本单点计算结果中,就可以生成NCI信息。 | 在ADF模块的基本单点计算结果中,就可以生成NCI信息。 | ||
- | {{ :adf:nci3.jpg?650 }} | + | {{ :adf:nci3.png?650 }} |
同时计算AIM,配合NCI分析: | 同时计算AIM,配合NCI分析: | ||
- | {{ :adf:nci4.jpg?650 }} | + | {{ :adf:nci4.png?650 }} |
=====结果查看===== | =====结果查看===== | ||
行 30: | 行 30: | ||
即可看到: | 即可看到: | ||
- | {{ :adf:nci1.jpg?500 }} | + | {{ :adf:nci1.png?500 }} |
- | Properties > AIM(Bader),看到CP与NCI的关系(NCI设置为透明:窗口底部的ISO surface: With Phase > Show Details > Opacity设置为20~50之间的数值即可,数值越小越透明): | + | Properties > QTAIM(Topology),看到CP与NCI的关系(NCI设置为透明:窗口底部的ISO surface: With Phase > Show Details > Opacity设置为20~50之间的数值即可,数值越小越透明): |
- | {{ :adf:nci2.jpg?500 }} | + | {{ :adf:nci2.png?500 }} |
其中红色小球是键临界点的位置,白色小球是原子的位置。可以看到这个二聚体的氢键临界点在NCI区域内。 | 其中红色小球是键临界点的位置,白色小球是原子的位置。可以看到这个二聚体的氢键临界点在NCI区域内。 |