adf:logp

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--- adf:logp [2016/05/04 20:11] – 创建 liu.jun
+++ adf:logp [2017/11/12 11:11] – liu.jun
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 ======如何计算分配系数logP======
+COSMO－RS模块的计算，都需要相应分子的＊.coskf文件，ADF自带一个普通分子的＊.coskf库（初次打开COSMO－RS会自动下载），以及离子液体＊.coskf库（需要手动下载，地址为：[[http://downloads.scm.com/Downloads/crs/ADFCRS-IL-2014.zip|http://downloads.scm.com/Downloads/crs/ADFCRS-IL-2014.zip]]）。下载完毕、解压之后，可以保存电脑中任何（不含中文、空格等非标准英文字符的）路径下面，使用的时候，临时导入所需的分子即可。如果库中没有自己想要计算的分子的话，自己手动制备也非常容易，制备＊.coskf的方法非常简单，参考[[adf:coskf|]]
-SCM > COSMO－RS打开COSMO－RS模块。之后点击Properties → Partition Coefficients (LogP)。计算前，准备coskf文件，参考费米科技WIKI>[[adf:coskf|]]
+SCM LOGO > COSMO-RS打开COSMO－RS模块，点击Compounds > Add Compound(s) 添加＊.coskf文件。为了更精确的计算，用户可以对窗口列出的所有导入的分子，更精细的描述：选中某个分子，右边会列出该分子的性质，下方Input Data中，用户应尽量正确输入关于分子的正确描述，例如Nring（芳香环原子个数）。
+SCM LOGO > COSMO－RS打开COSMO－RS模块。之后点击Properties → Partition Coefficients (LogP)。计算前，准备coskf文件，参考费米科技WIKI>[[adf:coskf|]]
 弹出的窗口中，点击：Preset Octanol-Water
-之后添加分子：
+{{:adf:logp01.png?500|}}
+设置两个相的摩尔比、摩尔体积、温度，之后点击run即保存任务（目录、文件名不要包含中文名和空格，否则会出错）并运行。
+之后，右边给出结果：
+{{:adf:logp02.png?300|}}
-{{:adf:logp01.png?300|}}
+**注意：**下图的“User Defined 2 components”可以自定义其他溶剂。

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