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--- adf:homolumo2020 [2022/02/10 15:24] – [5，查看HOMO、LUMO] liu.jun
+++ adf:homolumo2020 [2023/10/24 16:40] – [分子轨道组分分析] liu.jun
@@ 行 1: / 行 1: @@
-====== 单点能计算、HOMO、LUMO、电子亲和势、解离势的计算======
+====== 单点能计算、HOMO、LUMO、IP、EA的计算、分子轨道的组分分析======
 本文使用AMS2020.101完成计算。
 =====1，建模=====
@@ 行 5: / 行 5: @@
 导入优化好的分子（此处假定分子已经是优化好的结构，如果结构没有优化好，那么可以参考[[adf:geoopt2020]]）
-打开ADFjobs窗口，SCM - New Input打开新的Input窗口（Linux系统如果有桌面，那么在命令行输入ADFinput即打开Input窗口），File - Import Coordinates 可以读取xyz、mol等格式的坐标。
+打开AMSjobs窗口，SCM - New Input打开新的Input窗口（Linux系统如果有桌面，那么在命令行输入AMSinput即打开Input窗口），File - Import Coordinates 可以读取xyz、mol等格式的坐标。
 =====2，参数设置=====
@@ 行 21: / 行 21: @@
   * [[adf:pbsorlsf]]
-=====4，查看Bonding Energy=====
+=====4，查看Bonding Energy、单点能=====
 在*.logfile尾部有Bonding Energy信息：
 <code>
@@ 行 39: / 行 39: @@
 =====5，查看HOMO、LUMO=====
-可以在Input窗口，SCM - levels，或者在ADFjobs窗口，选中该任务，SCM - levels，从而打开该任务的结果的能级图：
+可以在Input窗口，SCM - levels，或者在AMSjobs窗口，选中该任务，SCM - levels，从而打开该任务的结果的能级图：
 {{ adf:2020homo-lumo07.png?650 }}
@@ 行 47: / 行 47: @@
 {{ adf:2020homo-lumo08.png?650 }}
-鼠标停留在分子轨道的时候，可以定量的显示贡献的百分比。蓝线表示形成杂化形成分子轨道、共价键。
+鼠标停留在分子轨道的时候，可以定量的显示轨道组分百分比。蓝线表示形成杂化形成分子轨道、共价键。
 {{ adf:2020homo-lumo09.png?600 }}
@@ 行 144: / 行 144: @@
   * 第五列数据为能级能量值，单位为eV
-=====IP与EA=====
+=====电离势IP与亲和势EA=====
 粗略的近似，HOMO、LUMO分别近似为IP、EA。更精确的计算，则：
-  * 垂直电离势：“电离前的优化结构，计算其失去1e后的单点能” - “电离前优化结构的单点能”
+  * 垂直电离势：“失e前的优化结构，计算其失1e后的单点能” - “失e前的优化结构的单点能”
-  * 垂直电子亲和势：“得电子前的优化结构的单点能” - “得电子前优化结构，计算其得1e后的单点能”
+  * 垂直电子亲和势：“得e前的优化结构的单点能” - “得e前的优化结构，计算其得1e后的单点能”
-  * 绝热电离势：“失电子后优化结构后的单点能” - “失电子前优化结构后的单点能”
+  * 绝热电离势：“失e后优化结构后的单点能” - “失e前优化结构后的单点能”
-  * 绝热电子亲和势：“得电子前优化结构后的单点能” - “得电子后优化结构后的单点能”
+  * 绝热电子亲和势：“得e前优化结构后的单点能” - “得e后优化结构后的单点能”
+另外用户可以参考：[[adf:gwipea]]
+=====分子轨道组分分析=====
+SCM → Level第二列为分子轨道，鼠标放置在某个轨道上，可以显示轨道的组分权重，例如下图鼠标放在二重简并的 HOMO 轨道，显示：
+{{ :adf:molweight01.png?650 }}
+即这二重简并的两个轨道，编号分别为 9AA、2AAA，其中 9AA 能级为 -0.383416 Hatree，占据电子数为 2.0，主要成分为 O 原子的第 1 个 Px（也就是 2Px）轨道贡献 36.01%，另一个 O 原子的第 1 个 Px（也就是 2Px）轨道贡献35.98%，两个 O 原子的第 1 个 Py轨道分别贡献 12.15%、12.12%，C的第1个 D$_{x^2-y^2}$（也就是3D$_{x^2-y^2}$）贡献2.86%。
+这里需要注意，轨道前面的数字，例如1P、1D是指第几个P、D轨道。如果 Frozen Core 设置为 None，则 1P、2P、3P…… 实际上分别指我们常说的 2P、3P、4P……，以此类推 1D、2D、3D……指 3D、4D、5D……。
+如果使用了冻芯近似，检查冻芯的级别，例如某个元素的冻芯基组是将3P以内电子冻结，那么 1P 就是指 4P 轨道。怎么看冻芯基组冻芯到什么程度呢？如果我们不太熟悉，在使用冻芯近似的时候，可以分别为每个元素指定冻芯基组，（指定方式参考：[[adf:parameters2020]]），冻芯基函数位于：AMS2023.104\atomicdata\ADF这个文件夹内，例如下属的 TZP 里面有 Ag.3d 这个基函数，那么这个基函数指Ag元素3d及其以内的电子被冻结。
 AMS软件提供**免费试用**，试用申请方式参见**：[[adf:trial|]]**

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