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adf:fragmentanalysis [2019/12/07 01:37] – [片段轨道布居] liu.jun | adf:fragmentanalysis [2020/11/20 21:44] – liu.jun | ||
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- | ======分子间相互作用能、分子之间相互作用能、键能、键解离能、结合能计算、键能分解EDA、片段轨道布居====== | + | ======EDA应用于分子间作用、氢键体系:作用能分解、片段轨道布居====== |
使用该功能发表的代表性工作: | 使用该功能发表的代表性工作: | ||
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片段是一个比较广义的概念,可以是分子的部分和部分之间相互作用,也可以是分子和分子之间的相互作用,方法原理都是一样。如果是分子内部一个区域与另一个区域相互作用,那么将这两个区域当成两个片段即可,如果是分子和分子间相互作用,那么将每个分子当成一个片段就可以了。如果要考虑相对论的片段分析,那么设置参数的时候,勾选 Main > Relativity > Scalar就可以了,目前ADF不支持Spin-Orbit的片段功能。 | 片段是一个比较广义的概念,可以是分子的部分和部分之间相互作用,也可以是分子和分子之间的相互作用,方法原理都是一样。如果是分子内部一个区域与另一个区域相互作用,那么将这两个区域当成两个片段即可,如果是分子和分子间相互作用,那么将每个分子当成一个片段就可以了。如果要考虑相对论的片段分析,那么设置参数的时候,勾选 Main > Relativity > Scalar就可以了,目前ADF不支持Spin-Orbit的片段功能。 | ||
- | 下面以分子内部区域与区域之间的相互作用为例子,来演示计算的过程。 | + | 下面以分子内部区域与区域之间的相互作用为例子,来演示计算的过程。使用AMS2019.03完成计算。 |
- | 1,创建分子(具体创建过程,可以参考:[[adf: | + | 1,建模的操作,参考:[[adf: |
- | 首先应该进行结构优化,之后才进行片段分析。结构优化如何使用?请参考:[[adf: | + | 首先应该进行结构优化,之后才进行片段分析。结构优化如何使用?请参考:[[adf: |
假定已经优化完成,如下演示的是片段分析的参数设置: | 假定已经优化完成,如下演示的是片段分析的参数设置: |