adf:fragmentanalysis
差别
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| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版上一修订版两侧同时换到之后的修订记录 | ||
| adf:fragmentanalysis [2019/12/07 01:36] – [注意] liu.jun | adf:fragmentanalysis [2020/11/20 21:44] – liu.jun | ||
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| - | ======分子间相互作用能、分子之间相互作用能、键能、键解离能、结合能计算、键能分解EDA、片段轨道布居====== | + | ======EDA应用于分子间作用、氢键体系：作用能分解、片段轨道布居====== |
| 使用该功能发表的代表性工作： | 使用该功能发表的代表性工作： | ||
| * [[http:// | * [[http:// | ||
| 行 12: | 行 12: | ||
| 片段是一个比较广义的概念，可以是分子的部分和部分之间相互作用，也可以是分子和分子之间的相互作用，方法原理都是一样。如果是分子内部一个区域与另一个区域相互作用，那么将这两个区域当成两个片段即可，如果是分子和分子间相互作用，那么将每个分子当成一个片段就可以了。如果要考虑相对论的片段分析，那么设置参数的时候，勾选 Main > Relativity > Scalar就可以了，目前ADF不支持Spin－Orbit的片段功能。 | 片段是一个比较广义的概念，可以是分子的部分和部分之间相互作用，也可以是分子和分子之间的相互作用，方法原理都是一样。如果是分子内部一个区域与另一个区域相互作用，那么将这两个区域当成两个片段即可，如果是分子和分子间相互作用，那么将每个分子当成一个片段就可以了。如果要考虑相对论的片段分析，那么设置参数的时候，勾选 Main > Relativity > Scalar就可以了，目前ADF不支持Spin－Orbit的片段功能。 | ||
| - | 下面以分子内部区域与区域之间的相互作用为例子，来演示计算的过程。 | + | 下面以分子内部区域与区域之间的相互作用为例子，来演示计算的过程。使用AMS2019.03完成计算。 |
| - | 1，创建分子（具体创建过程，可以参考：[[adf: | + | 1，建模的操作，参考：[[adf: |
| - | 首先应该进行结构优化，之后才进行片段分析。结构优化如何使用？请参考：[[adf: | + | 首先应该进行结构优化，之后才进行片段分析。结构优化如何使用？请参考：[[adf: |
| 假定已经优化完成，如下演示的是片段分析的参数设置： | 假定已经优化完成，如下演示的是片段分析的参数设置： | ||
| 行 59: | 行 59: | ||
| ====片段轨道布居==== | ====片段轨道布居==== | ||
| + | SCM LOGO > Output > Properties > %SFO per orbital，会显示类似如下内容： | ||
| + | < | ||
| === AA === | === AA === | ||
| - | SCM LOGO > Output > Properties > %SFO per orbital，会显示类似如下内容： | ||
| - | < | ||
| SFO contributions (%) per orbital | SFO contributions (%) per orbital | ||
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| 行 130: | 行 130: | ||
| 24SFO是哪个轨道呢？可以查询。点击Properties > SFO construction，看到AA不可约表示中的SFO列表（同样地，需要看对应的不可约表示，例如这里需要看AA）： | 24SFO是哪个轨道呢？可以查询。点击Properties > SFO construction，看到AA不可约表示中的SFO列表（同样地，需要看对应的不可约表示，例如这里需要看AA）： | ||
| - | < | + | < |
| === AA === | === AA === | ||