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adf:ets-nocv-cycloaddition

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后一修订版		前一修订版
上一修订版两侧同时换到之后的修订记录
adf:ets-nocv-cycloaddition [2016/05/26 23:54] – liu.junadf:ets-nocv-cycloaddition [2020/11/23 12:57] – liu.jun
行 1: 行 1:
-======ETS-NOCV计算：以环己烯为例，拆分为三重态的片段======+======ETS-NOCV计算：环己烯分为两个三重态片段======
  
 **1，优化反应物** **1，优化反应物**
  
-创建分子、优化分子结构，从而得到H-CN的结构。如何建模、优化具体参考： +建模的操作，参考：[[adf:buildmodel|AMS软件建模教程]]。
-  * [[http://pan.baidu.com/s/1c0jSBIC|建模：ADF模块分子的基本建模功能演示（视频下载）]] +
-  * [[adf:1000atomsball]] +
-  * [[adf:geoopt]] +
-  * [[adf:geooptforbigsystem]] +
-  * [[adf:parameters]] +
-  * [[adf:结构优化不收敛]]+
  
-[[http://pan.baidu.com/s/1pKG6RAb|对应的文件下载（点击）]]。+优化分子结构参考：[[adf:geoopt2019]]
  
-各个文件的含义，参考： 
-  * [[adf:adffiles]] 
  
-**2，对优化好的结构，提取出来，进行片段分析的计算（[[http://pan.baidu.com/s/1o8H5eSq|计算文件下载]]）：**+**2，对优化好的结构，提取出来，进行片段分析的计算：{{ :adf:cyclohexene-ets-nocv.zip |计算文件下载}}** 
   * [[adf:updategeotry]]   * [[adf:updategeotry]]
  
-参数设置如下（基组、泛函等参数选择可以参考：[[adf:parameters]]）：+参数设置如下（基组、泛函等参数选择可以参考：[[adf:parameters2019]]）：
  
 {{ :adf:etsnocvp30.png?600 |}} {{ :adf:etsnocvp30.png?600 |}}
 +
 +任务类型，在旧版本里面有Fragment Analysis，在新版里面去掉了这个选项，因为这个选项实际上和Single Point是一样的。
  
 {{ :adf:etsnocvp31.png?600 |}} {{ :adf:etsnocvp31.png?600 |}}
行 61: 行 56:
  
 {{ :adf:etsnocvp36.png?600 |}} {{ :adf:etsnocvp36.png?600 |}}
 +
 +其中：
 +  OCCUPATIONS
 +  A 10 1 1 
 +  END
 +因为总共12个电子（2个C原子的4个电子被冻结了）表示能量较低的10个电子，采用双占据，剩余2个电子占据在更高的两个轨道——一般而言，这就是三重态。类似地：
  
 Region_2的参数设置改动的地方如下： Region_2的参数设置改动的地方如下：
行 86: 行 87:
 **3，结果查看与分析** **3，结果查看与分析**
  
-查看结果的操作，参考：[[adf:结果文件查看]]+查看结果的操作，参考：[[adf:showresults]]
  
 这样得到了文献中Table 2中对应的数据： 这样得到了文献中Table 2中对应的数据：
行 153: 行 154:
 **其次，查看形变密度Δρ<sub>1</sub>（红色区域表示电子流出，蓝色表示电子流入该区域）** **其次，查看形变密度Δρ<sub>1</sub>（红色区域表示电子流出，蓝色表示电子流入该区域）**
  
-Add > Isosurface: Double(+/-)，之后在下方Select Field选择Other...> C-1。如此图中即显示Δρ<sub>1</sub>。调整等值面的值为0.005，并点击Isosurface: Double > Show Details > Opacity改为10，并勾选Isosurface: Double 左边的框☑️，如此则得到图示：+Add > Isosurface: With Phase，之后在下方Select Field选择Other...> C-1。如此图中即显示Δρ<sub>1</sub>。调整等值面的值为0.005，并点击Isosurface: With Phase > Show Details > Opacity改为10，并勾选Isosurface: With Phase 左边的框√，如此则得到图示：
  
 {{ :adf:etsnocvp46.png?700 |}} {{ :adf:etsnocvp46.png?700 |}}
行 176: 行 177:
 **其次，查看形变密度Δρ<sub>2</sub>（红色区域表示电子流出，蓝色表示电子流入该区域）** **其次，查看形变密度Δρ<sub>2</sub>（红色区域表示电子流出，蓝色表示电子流入该区域）**
  
-Add > Isosurface: Double(+/-)，之后在下方Select Field选择Other...> C-2。如此图中即显示Δρ<sub>2</sub>。调整等值面的值为0.005，并点击Isosurface: Double > Show Details > Opacity改为10，并勾选Isosurface: Double 左边的框☑️，同时去掉C－1的勾选，如此则得到图示：+Add > Isosurface: With Phase，之后在下方Select Field选择Other...> C-2。如此图中即显示Δρ<sub>2</sub>。调整等值面的值为0.005，并点击Isosurface: With Phase > Show Details > Opacity改为10，并勾选Isosurface: With Phase 左边的框√，同时去掉C－1的勾选，如此则得到图示：
  
 {{ :adf:etsnocvp49.png?500 |}} {{ :adf:etsnocvp49.png?500 |}}
行 189: 行 190:
  
 我们计算得到的该值为：-183.49762  (kcal/mol) 我们计算得到的该值为：-183.49762  (kcal/mol)
 +
 +<color blue>NOCV orbital、NOCV density、NOCV Def(ference) density的化学直观含义，参考：[[adf:theoryofets-nocv]]</color>

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