adf:clusterfix
差别
| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版后一修订版两侧同时换到之后的修订记录 |
| adf:clusterfix [2019/04/15 00:20] – [2，修改程序的权限] liu.jun | adf:clusterfix [2019/04/15 00:22] – [4，环境变量如何生效] liu.jun |
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| =====3，设置环境变量===== | =====3，设置环境变量===== |
| 在解压生成的ADF2016.104目录内，有一个文件，名为adfrc.sh或adfbashrc.sh，用户仅仅<color blue>需要修改其中2项</color>（ADFHOME、SCM_TMPDIR）即可： | 在解压生成的ADF2019.101目录内，有一个文件，名为adfbashrc.sh，用户可以在 |
| <code bash> | <code bash> |
| export ADFHOME=/public/software/adf2016.104 | export ADFHOME ADFBIN ADFRESOURCES |
| export SCM_TMPDIR=/tmp | </code> |
| | 前面增加一行： |
| | <code bash> |
| | export ADFHOME=/public/software/adf2019.101 |
| </code> | </code> |
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| 说明： | 说明： |
| | * 这里的/public/software/adf2019.101即第1步解压产生的目录/public/software/adf2019.101（当然也可以是其它目录，例如：/home/UserID/adf2019.101） |
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| * 这里的/public/software/adf2016.104即第1步解压产生的目录/public/software/adf2016.104（当然也可以是其它目录，例如：/home/UserID/adf2016.104） | 在文件最后增加一行： |
| * /tmp这个目录要注意经常清理，避免大量垃圾堆积；计算过程中从该目录读取数据的速度，对计算的效率有一定影响，但一般/tmp这个本机目录，速度是很快的；这个目录对AMS用户需要有读写权限。如果设置export SCM_TMPDIR=$PWD，那么临时文件将产生到提交任务的目录。这样在PBS、LSF脚本中最后一行加一句rm -rf kid* t21.*删除掉临时文件即可。 | <code bash> |
| | export SCM_TMPDIR=/tmp |
| | </code> |
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| | * /tmp这个目录要注意经常清理，避免大量垃圾堆积；计算过程中从该目录读取数据的速度，对计算的效率有一定影响，但一般/tmp这个本机目录，速度是很快的；这个目录对AMS用户需要有读写权限。如果设置export SCM_TMPDIR=$PWD，那么临时文件将产生到提交任务的目录。这样在PBS、LSF脚本中最后一行加一句rm -rf kid* t21.*删除掉临时文件即可。 |
| =====4，环境变量如何生效===== | =====4，环境变量如何生效===== |
| 因此PBS/LSF提交作业的时候，在PBS脚本中增加一句source /public/software/adf2016.104/adfrc.sh，具体参考adf:pbsorlsf。 | 因此PBS/LSF提交作业的时候，在PBS脚本中增加一句source /public/software/adf2019.101/adfbashrc.sh，具体参考[[adf:pbsorlsf]] |
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| 如果是SLURM系统，用户可以把这一句写到~/.bashrc文件中，或者由root用户写入/etc/profile文件尾部，之后source ~/.bashrc或source /etc/profile即可。 | 如果是SLURM系统，用户可以把这一句写到~/.bashrc文件中，或者由root用户写入/etc/profile文件尾部，之后source ~/.bashrc或source /etc/profile即可。 |
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| =====5，获取机器信息（用于申请license）===== | =====5，获取机器信息（用于申请license）===== |
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adf/clusterfix.txt · 最后更改: 2024/05/31 16:11 由 liu.jun
