adf:changeofgibbs
差别
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| 两侧同时换到之前的修订记录前一修订版后一修订版 | 前一修订版上一修订版两侧同时换到之后的修订记录 | ||
| adf:changeofgibbs [2017/07/01 21:16] – liu.jun | adf:changeofgibbs [2019/12/31 17:15] – liu.jun | ||
|---|---|---|---|
| 行 1: | 行 1: | ||
| ======如何计算溶液中氧化还原Gibbs自由能变化====== | ======如何计算溶液中氧化还原Gibbs自由能变化====== | ||
| - | 气体分子的Gibbs自由能计算请参考费米维基：[[adf: | + | 气体分子的Gibbs自由能计算请参考费米维基：[[adf: |
| DFT as a Powerful Predictive Tool in Photoredox Catalysis: Redox Potentials and Mechanistic Analysis, Organometallics 2015, 34, 4218−4228 | DFT as a Powerful Predictive Tool in Photoredox Catalysis: Redox Potentials and Mechanistic Analysis, Organometallics 2015, 34, 4218−4228 | ||
| 行 15: | 行 15: | ||
| 第三项：氧化产物PC< | 第三项：氧化产物PC< | ||
| - | 我们以该文的Supporting Information的Table S1中PC1(+2)为例，说明PC1(+2)的这三个部分数值如何计算。下文中，PC1（2+）是文献中的表示方法，即PC1< | + | 我们以该文的Supporting Information的Table S1中PC1(+2)为例，说明$PC1^{2+}$的这三个部分数值如何计算。下文中，PC1（2+）是文献中的表示方法，即PC1< |
| **表S1：** | **表S1：** | ||
| 行 22: | 行 22: | ||
| {{ : | {{ : | ||
| - | 1，首先计算PC1（2+）的气相Gibbs自由能，也即表S1中的Gas-phase，计算方法参考费米维基：[[adf: | + | 1，首先计算$PC1^{2+}$的气相Gibbs自由能，也即表S1中的Gas-phase，计算方法参考费米维基：[[adf: |
| 得到的Gas-phase Gibbs自由能为：-9090.487kcal/ | 得到的Gas-phase Gibbs自由能为：-9090.487kcal/ | ||
| - | 2，类似地计算PC1（2+）在MeCN溶液中的Gibbs自由能（与1的区别仅仅在于多了model > Salvation的溶剂化设置），类似地得到Gibbs free energy。 | + | 2，类似地计算$PC1^{2+}$在MeCN溶液中的Gibbs自由能（与1的区别仅仅在于多了model > Salvation的溶剂化设置），类似地得到Gibbs free energy。 |
| - | 3，依照上述类似的方法，分别计算PC1（2+）去掉一个电子之后，PC1（3+）的气相Gibbs自由能以及在MeCN溶液中的Gibbs自由能（均需另做结构优化）。 | + | 3，依照上述类似的方法，分别计算$PC1^{2+}$去掉一个电子之后，$PC1^{3+}$的气相Gibbs自由能以及在MeCN溶液中的Gibbs自由能（均需另做结构优化）。 |
| **注意：ADF2016后的版本，计算Gibbs Free Energy数值与下面略有不同，但方法是一样的。** | **注意：ADF2016后的版本，计算Gibbs Free Energy数值与下面略有不同，但方法是一样的。** | ||
| - | 4，计算公式1中第一项，PC1(2+)的△G< | + | 4，计算公式1中第一项，$PC1^{2+}$的△G< |
| ΔG(gas) | ΔG(gas) | ||
| - | =PC1（2+）的气相Gibbs自由能-PC1（3+）的气相Gibbs自由能 | + | =$PC1^{2+}$的气相Gibbs自由能-$PC1^{3+}$的气相Gibbs自由能 |
| =-9091.7579-（-8795.4794） | =-9091.7579-（-8795.4794） | ||
| 行 42: | 行 42: | ||
| =-296.3 kcal/mol | =-296.3 kcal/mol | ||
| - | 5，计算公式1中第二项，PC1(2+)的△G< | + | 5，计算公式1中第二项，$PC1^{2+}$的△G< |
| ΔG(solv.PC) | ΔG(solv.PC) | ||
| - | =在MeCN溶液中的Gibbs自由能-气相的Gibbs自由能（采用文献中的数值） | + | =$PC1^{2+}$在MeCN溶液中的Gibbs自由能-$PC1^{2+}$气相的Gibbs自由能（采用文献中的数值） |
| =-9213.1284-(-9091.7579) | =-9213.1284-(-9091.7579) | ||
| 行 52: | 行 52: | ||
| = -121.3705 kcal/mol | = -121.3705 kcal/mol | ||
| - | 6，计算公式1中第三项，PC1(2+)的△G< | + | 6，计算公式1中第三项，$PC^{2+}$的△G< |
| ΔG(solv.PC+) | ΔG(solv.PC+) | ||
| - | =在MeCN溶液中的Gibbs自由能-去掉一个电子后在MeCN溶液中的Gibbs自由能 | + | =$PC1^{3+}$在MeCN溶液中的Gibbs自由能-$PC1^{3+}$气相的Gibbs自由能 |
| - | =-9213.1284-(-9085.2758) | + | -9085.2758-(-8795.4795) |
| - | =-127.8526 kcal/mol | + | =-289.8 kcal/mol |
| - | 7，计算PC1（2+）在MeCN溶液中氧化还原Gibbs自由能变化： | + | 7，计算$PC1^{2+}$在MeCN溶液中氧化还原Gibbs自由能变化： |
| △G< | △G< | ||