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adf:如何优化分子的几何结构 [2015/05/09 23:11] – fermi | adf:如何优化分子的几何结构 [2016/05/10 23:31] – liu.jun | ||
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====== 如何优化分子的几何结构 ====== | ====== 如何优化分子的几何结构 ====== | ||
- | 此处以氧气分子举例:优化中性O2分子: | + | 此处以氧气分子举例:优化中性< |
**1,参数设置** | **1,参数设置** | ||
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注意,O2的基态是三重态(两个电子未配对),因此Spin Polarization设为2。因为O2很小因此为了省事,直接把优化的基组设置成了TZP,实际上分子比较大的时候设置为DZP更好(省时间),然后优化结束之后,再计算single point即可。本例中对总能量很感兴趣,因此PBE的效果会好于B3LYP。 | 注意,O2的基态是三重态(两个电子未配对),因此Spin Polarization设为2。因为O2很小因此为了省事,直接把优化的基组设置成了TZP,实际上分子比较大的时候设置为DZP更好(省时间),然后优化结束之后,再计算single point即可。本例中对总能量很感兴趣,因此PBE的效果会好于B3LYP。 | ||
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一般结构优化完成之后,会进行频率计算,检查是不是存在虚频。如果存在虚频,则表示优化不精确,需要继续优化。但这个问题在ADF一般很少出现。因此,对于非弱键的体系,都可以省去这一步。如果不放心,可以进行频率计算。 | 一般结构优化完成之后,会进行频率计算,检查是不是存在虚频。如果存在虚频,则表示优化不精确,需要继续优化。但这个问题在ADF一般很少出现。因此,对于非弱键的体系,都可以省去这一步。如果不放心,可以进行频率计算。 | ||
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+ | ADF软件提供**免费试用**(一般为一个月),试用申请方式参见**费米科技维基百科:[[adf: |